Quando a promotora auxiliar é encontrada morta imediatamente a equipe da agente Lisbon é colocada a frente das investigações. Apesar de concordar com o empenho demonstrado por todos, Jane questiona como o caso é tratado e sua prepotência e arrogância podem colocar tudo a perder.

Ao ajudar uma jovem que está ferida e com amnésia, Patrick e seus amigos descobrem o local de um brutal assassinato. As investigações levam os agentes do CBI até uma reserva indígena. Quando Madeleine Hightower descobre que os agentes Van Pelt e Rigsby mantêm um relacionamento amoroso, ela os obriga a
tomarem uma decisão, já que as normas não permitem casais trabalhando numa mesma unidade.

Enquanto Madeleine Hightower é designada para chefiar a CBI, o que causa um certo medo e insegurança em Lisbon, o pessoal da agência é chamado para investigar o assassinato do professor James que foi encontrado morto na casa da piscina do fotógrafo Hopper Banks.

Quando a Dra. Alicia Seberg das empresas Biosistemas Zitek é exposta, de forma criminosa, a um vírus letal ela pede que Jane descubra quem quer matá-la.

Patrick e a equipe do FBI investigam o assassinato, por envenenamento, de um conceituado chefe de cozinha durante uma famosa competição em Napa Valley.

Ao receber a notícia que seu antigo amigo David foi encontrado morto, Kim prefere se manter indiferente, já que tem certeza que o crime está relacionado ao fato de David ainda ser membro de uma perigosa gangue. Mesmo não querendo se envolver e mostrando certa frieza, Kim é convencido por seus colegas de trabalho que quando o passado bate em sua porta o melhor é tentar investigar o que está acontecendo.

A equipe da CBI é chamada quando o corpo de Liselle, vendedora de uma luxuosa concessionária, é encontrado dentro do porta malas de um dos carros que estava em exposição. Muitos de seus antigos amigos não se mostram abalados pela perda e só pensam em como conquistar os clientes que ela deixou. Lisbon se vê obrigada a informar a seus superiores o relacionamento amoroso que seus subordinados estão mantendo. 

Lisbon e sua equipe são obrigados a colaborarem com um equipe de televisão que está realizando uma grande matéria sobre o CBI. O promotor público pede que Lisbon investigue o assassinato de Marta, uma das assessoras da prefeita da cidade de Salter, que estava trabalhando em um grande projeto.

Selby e Jana são encontrados mortos dentro de seu carro em local isolado da pequena cidade de Rancho Rosa. Patrick descobre que o casal estava indo para a festa de reencontro do colégio local. Os agentes ficam intrigados ao descobrirem que mesmo não tendo se formado e de não ter comparecido nos últimos  encontros, Selby confirmou presença em todos os eventos desse ano. Enquanto Grace Van Pelt faz trabalho de campo, Wayne Rigsby é obrigado a realizar trabalho burocrático.

Ao investigarem o assassinato de Sloop, um grande empresário do ramo esportivo, Patrick, é atingido na cabeça por uma bola de beisebol. A partir desse momento o consultor da CBI passa ter flashes da sua juventude, de quando ele e seu pai aplicavam pequenos golpes.

Enquanto alguns agentes da CBI estavam em um evento beneficente para levantar fundos para o departamento, a tradicional joalheria Douerton, pertencentes aos anfitriões da recepção, é assaltada e um de seus proprietários e gravemente baleado. Jane acredita que algum membro da família possa estar envolvido, já seus parceiros discordam.

Durante uma investigação de assassinato no qual um corpo é encontrado nú em um cemitério, o sempre observado Patrick além de descobrir provas do crime desconfia que Van Pelt e Rigsby estão tendo um caso. A equipe do agente especial Bosco é executada dentro do prédio da CBI enquanto trabalhavam. Apesar de gravemente ferido, Bosco ainda está vivo e é levado ao hospital. Com o prédio isolado Lisbon e seus agentes procuram provas e que possam levar aos culpados.

Após um incidente duas equipes do CBI são obrigadas a trabalharem juntas para resolverem um complicado caso de sequestro. Mesmo contrariado o agente especial Bosco tem que passar por cima das suas desavenças pessoais com Patrick Jane e colaborar com a equipe da agente Lisbon.

Patrick é preso depois que as escutas clandestinas que pôs na sala do oficial Bosco são descobertas. Mesmo fora da ativa Jane encontra uma maneira bem particular de ajudar Lisbon e seus agentes a solucionar um assassinato.

A arquiteto Alan é encontrado morto na mansão que acabara de comprar e que pretendia reformar. As provas do crime sugerem que um fantasma é o responsável pelo assassinato. Como Patrick não acredita em seres sobrenaturais ele e a equipe de agentes do CBI procuram evidências que possam levar ao real culpado.

A equipe do CBI passa a investigar a perigosa gangue de motoqueiros conhecida como "Santos Pecadores" depois que seu advogado Gordon é encontrado morto. Os agentes ainda descobrem que dias antes de ser assassinado Gordon foi preso por posse ilegal de drogas, mas misteriosamente a promotoria retirou todas as acusações.

Depois de receber uma dica anônima, a equipe da CBI encontra o cadáver de um pedófilo que Lisbon prendeu há anos com Sam Bosco. Agora Lisbon vira a principal suspeita do crime.

Lisbon e sua equipe trabalham no caso do assassinato de um estagiário do senador, enquanto Jane tenta, simultaneamente, tenta descobrir que novas informações Bosco encontrou sobre o caso de Red John.

O caso de Red John é tirado das mãos dos agentes do CBI e dado de volta ao agente Sam Bosco, então Jane e Lisbon apenas podem assistir à investigação. Agora o  CBI investiga o assassinato de uma mulher que foi encontrada sufocada depois de ter sido acusada de roubar milhões de dólares de seu empregador.

Para chamar a atenção de Patrick, o serial killer, Red John faz mais uma vítima e seqüestra outra e para ter certeza que Patrick assumiria o caso e o meticuloso assassino ainda deixa sua marca registrada. Para Patrick,  Red só quebrou o seu padrão de agir porque conhece muito bem as vítimas ou alguém muito próximo delas.

Justin, um garoto problema que estuda num colégio especializado para jovens problemáticos como ele, é encontrado morto no meio da floresta. As evidências indicam que alguém da sua escola possa estar envolvido com o assassinato. Mas como ganhar a confiança de um monte de adolescentes que preferem se esconder atrás de seus problemas.

Quando a polícia local se recusa a investigar o desaparecimento de um empresário o caso vai parar nas mãos dos agentes do CBI. Patrick logo descobre que o empresário foi morto, seu corpo amarrado na âncora de seu barco e depois atirado ao mar. Com poucas pistas e muitos suspeitos, os investigadores estão se desdobrando para solucionar mais esse caso.

Apesar do clima de confraternização, Teresa fica chateada por Patrick esquecer de seu presente de aniversário. A festinha da agente é interrompida quando um corpo de um homem é encontrado e o caso é dado aos agentes de sua divisão. Patrick descobre que a vítima além de trabalhar num fliperama, participava do programa de proteção a testemunha, pois estava envolvida com perigosos mafiosos.

Felix Hanson, um riquíssimo deputado da Califórnia, é encontrado morto nas ruas da cidade com três tiros no peito. Durante sua vida pública ele fez inúmeros inimigos, pois sempre liderou campanhas contra o tráfico. Felix passa de bom moço a vilão quando os investigadores do CBI encontram um grande quantidade de drogas em seu carro, porém eles ainda precisam descobrir quem e por que o político foi morto.

Acreditando estar arrastando um saco de batatas, um homem invade o prédio do CBI, mas para surpresa de todos no saco havia o corpo de uma mulher morta. Enquanto todos acham que ele é louco ou mentiroso, Patrick acredita que ele esteja hipnotizado. Em uma corrida contra o tempo os agentes precisam analisar todas as provas para tentar descobrir a verdade.

Depois de receber um e-mail com coordenadas precisas sobre um assassinato, a equipe do CBI decide investigar o caso e para surpresa de todos tudo acontece conforme a denúncia. A vítima era um alto executivo que estava praticando pára-quedismo com seus colegas de trabalho. Seu pára-quedas foi sabotado e ele despencou para morte.

Após receber uma carta ameaçadora de um terrorista, Patrick localiza uma bomba, porém o consultor do CBI não consegue desativá-la a tempo. A explosão além de matar um refém que estava amarrado a bomba também deixa Patrick com cegueira momentânea. Apesar de debilitado o investigador quer ajudar seus companheiros a encontrar o culpado.

Os agentes do CBI estão investigando a morte de Scarlett, uma milionária que foi envenenada durante uma festa em sua casa. O pessoal da agência acredita que o crime foi motivado por revanche e decidem ampliar o leque de suspeitos investigando também todos os membros de um importante clube da qual a vítima era a presidente.

A esposa de um importante empresário é morta enquanto estava em um spa. Como tem inúmeros amigos no gabinete do governador ele pede que as investigações sejam feitas com a maior discrição possível, já que sua esposa o estava traindo.

Vice presidente de uma poderosa organização é encontrado morto, em seu escritório, pelo chefe da segurança e pela recepcionista quando esses mantinham um encontro amoroso. Para justificarem a presença na sala do chefe o casal muda a cena do crime. Porém a mentirinha é logo descoberta por Patrick e os dois são obrigados a contar toda a verdade. Além do assassinato, o pessoal da CBI também tem que investigar o roubo de um valioso quadro que sumiu da empresa.

A equipe do CBI é acionada depois que o sapato de Cody Elkins, um jovem de apenas 16 anos e desaparecido há dois dias, é achado jogado na sarjeta. Muito observador, Patrick logo encontra o corpo do garoto no meio da floresta. As pista sugerem que ele foi morto após um cerimonia de magia negra. Assim as investigações se voltam para a única bruxa da cidade.

Um assassino julgado e condenado a 25 anos de prisão faz uma proposta a Patrick Jane. Caso ele consiga provar sua inocência e tirá-lo da cadeia, o criminoso promete lhe dar informações que possam levar a "Red John". Sem autorização para reabrir o caso e proibido de investigá-lo, Patrick passa por cima das ordens superiores e inicia uma investigação particular.

Alex Nelson, uns dos principais astronautas do país, morre envenenado no exato momento que iria discursar no 8º simpósio anual de neurociência. Quando a doutora Sophia Miller, principal suspeita do crime, ex-exposa da vítima e sua amiga particular lhe pede ajuda, Patrick não vê outra saída a não ser pedir que a agente Lisbon seja a responsável pelas investigações. Mas para ter o apoio da investigadora, Patrick terá que revelar um grande segredo.

A equipe da agente Lisbon investiga um assassinato num incêndio em uma fazenda em Marquesa. Os investigadores descobrem que anos atrás uma outra pessoa também morreu na região vítima de incêndio, coincidência ou não os dois faziam parte da mesma unidade da guarda nacional.

Uma importante testemunha do estado contra um perigoso traficante de drogas é encontrada morta ao lado de uma jovem em um motel. Para surpresa dos investigadores da CBI, a testemunha não tinha proteção policial. Por imposição de seus superiores, a CBI e a polícia local terão que trabalhar em parceria, mas além de terem opiniões diferentes sobre os mandantes do crime, os policiais locais não pretendem trabalhar em conjunto e nem querem a colaboração de ninguém.

Rose Mary foi perseguida e morta quando saia da casa de sua conselheira espiritual, enquanto Patrick acredita, quase cegamente, que a vidente é a culpada pelo assassinato, os investigadores da CBI tem outros suspeitos. A única coisa que todos concordam é que ela foi morta por causa de sua imensa fortuna, já que a vítima pretendia realizar algumas mudanças em seu testamento.

A mão de Jim Meier é encontrada na estrada que liga nevada a Califórnia. Sem muitas pistas que possam esclarecer o caso, Patrick e os investigadores decidem iniciar as investigações no cassino que Jim Gerenciava.

As amigas Nicole e Kara desaparecem após comemorarem o noivado de Nicole. Enquanto Kara era um anjo, Nicole era a garota problema. Com a habilidade de extrair o máximo que está ao seu redor, o sempre observador Patrick encontra o corpo de Kara. Tal fato faz com que a polícia local acredite que Nicole matou Kara e depois se escondeu nas montanhas, mas para o consultor da CBI a jovem é inocente e o culpado faz parte do grupo de busca.

Quando Jason Sanos, um grande contribuidor político, desaparece misteriosamente, o promotor público imediatamente convoca a equipe da agente Lisbon para liderar as investigações. Sempre observador, Jane logo acha o corpo de Jason, então eles passam a investigar como, por quê e quem teria motivos para matá-lo?

Chistine Tanner, uma menina de apenas 15 anos, é encontrada afogada na praia de Santa Monica. Apesar de todos acharem que foi um acidente a equipe da CBI tem evidências que a menina foi morta. Sem muitas provas, os investigadores centralizam as investigações entre familiares e amigos da vítima.

Em uma cidadezinha do interior, a equipe da agente Teresa Lisbon está investigando a morte de Melanie. Enquanto todos acham que a jovem foi vítima de um viciado da cidade grande ou de um namorado ciumento, Jane acredita que o responsável pelo crime além de morar na região não queria que as coisas acabassem daquela maneira.

Por anos Patrick Jane (Simon Baker) ganhou muito dinheiro alegando ser um médium vidente. No auge da carreira o charlatão abandona tudo e vira consultor independente da CBI, a agência de investigação da Califórnia, depois de ter insultado o mistério serial killer "Red John", em um programa de tv, e como conseqüência perder esposa e filho. Red John é um especialista que adora deixar no local do crime a sua marca, a figura de um rosto desenhado com o sangue de sua vítima. Usando apenas sua alta capacidade de observação unida a uma extrema percepção de tudo que está ao seu redor, Jane está ajudando a CBI a investigar a morte de uma famoso médico e sua paciente. As primeiras pistas levam ao misterioso serial killer "Red John".