Mesmo advertido que morreria no dia seguinte, Clark aposta que poderá mandar o apocalipse para o futuro, poupando assim a vida de Davis. Para seu desespero Chloe desaparece com o monstro. Clark convoca a liga para ajudá-lo a atrair David e então separar o "homem da fera"! Oliver discorda, acha que a única saída é matá-lo e, percebendo o perigo, ele seda Clark. Enquanto isso Jimmy descobre que Tess rastreia Chloe e Davis! Jimmy socorre Clark e descobre seu Segredo. Quando encontram Chloe, Jimmy e o monstro se enfrentam mortalmente. No enterro de Jimmy, Clark se despede de Chloe e confessa se sentir culpado pela morte de Jimmy e, teme também, que o pior tenha acontecido a desaparecida Lois Lane.

Tess insinua que Clark tem medo de seu destino. Uma falsa Chloe, pertencente a uma liga de estranhos criada por Tess se aproxima de Clark para obrigá-lo a matar Davis. Quando Clark descobre e, em seguida revela, aos membros da liga como eram controlados por Tess, eles se revoltam e querem justiça!

Jimmy, aparentemente, está usando drogas e procura Oliver. Só Chloe sabe as razões que a levam a esconder o perigoso Davis no porão. Ela é capaz de tudo para evitar o confronto entre Clark e a Besta. Mesmo sabendo que Davis quer matá-lo, o lado humano de Clark fala mais alto e ele decide mandá-lo para a Zona Fantasma! Mas Chloe dá um outro rumo à história fugindo com Davis!

Lois Lane, ainda obcecada com a ideia de entrevistar o super herói da cidade, enfrenta ladrões que atacavam Chloe.  Aclamada heroína e sentindo como tal, Lois cria uma "fantasia" e se intitula "salto alto". Infelizmente os ladrões levaram o lap top de Chloe contento informações "sigilosas"! Clark tenta recuperá-lo mas, por conta de um uso curioso de kriptonita, se mostra fraco e mais uma vez Lois Lane se passa por heroína! Lois chega ao ponto de "criar" uma entrevista exclusiva com nova super heróina! Era a chance de se tornar uma repórter famosa e respeitada! Mas o perigo ronda lois lane quando mafiosos violentos decidem se vingar de "salto fino"!

Através de Tess se descobre a origem de Davis, ou seja, quando e como ele chegou em Pequenópolis, bem como as razões porque ele se opõe a Clark! Isso talvez explique a razão de Tess tentar matá-lo numa explosão! Ele sobrevive e, refeito milagrosamente das queimaduras, pede a Chloe que o ajude a morrer! Ele confessa para Chloe que é imortal e que só não matará Clark se ela estiver com ele!

Durante sua festa de aniversário Chloe está triste com o rumo de sua vida e até inveja a alegria de Lois Lane! Em seguida uma bela jovem chamada Zatanna lhe oferece um desejo ao apagar uma vela! E eis que no dia seguinte Chloe amanhece "Lois" e vice versa! Cenas hilárias esperam por "Lois" no convívio com Clark no planeta diário! A "mágica" Zatanna procura Oliver para ajudá-la a recuperar um livro que fora de seu pai e atualmente se encontra na Luthorcorp! Zatanna também "enfeitiça" Clark que, sem poderes, deixa Chloe em apuros. Quando Oliver percebe o perigo que o tal livro representa tenta detê-la!

Davis diz no confessionário que há uma besta dentro de si. Jimmy, ainda abalado continua internado no hospital depois do ataque que sofreu no dia do seu casamento por um monstro. Ao flagrar Davis matando um homem no hospital, Davis alega que se trata de alucinações. A falta de apoio de Chloe leva Jimmy a se afastar dela. Rumo a Los Angeles, num jato da Luthorcorp, Tess parece já saber o segredo de Clark, mas para ter certeza tenta uma manobra nos ares: uma falsa turbulência para obrigar Clark a entrar em ação!

A perversa jornalista Linda Lake ameaça publicar toda a verdade sobre Clark, caso ele se negue a dar uma entrevista exclusiva para ela! Em meio a toda pressão Clark decide se revelar e por isso conta toda a verdade a Lois Lane! Clark vai parar na primeira página do jornal, aplaudido por todos. Revoltada, Linda Lake agora acusa Clark de ser o assassino de Lex! Em meio ao caos Clark recorre a um anel que faria o tempo voltar! Davis está de volta e conta a Chloe que é um criptoniano enviado para matar Clark!

Numa reunião em que Oliver anunciaria compra da Luthorcorp pelo grupo que ele dirige, uma explosão, mata muitos dos seus executivos. Ao sobreviver Oliver atribui a Lex Luthor o crime e está determinado a matá-lo. Lana, agora investida de poderes, retoma o velho romance e está pronta para ajudar Clark nas investigações. Mas uma descoberta com cara de armadilha de Lex, pode por fim a união de Clark e Lana! Oliver mata Lex e omite o fato de Clark.

Lana desapareceu! Teria partido? Tess está enfurecida por descobrir que Lex a vigiava o tempo todo e ela conta para Clark que Lex está vivo e que Lana pode ter sido sequestrada por ele. Também aproveita e conta tudo o que aconteceu com Lana enquanto esteve "desaparecida". Chloe não tem como não contar para Clark o real motivo que fez Lana voltar a Pequenópolis!

Lana, mais misteriosa do que nunca, procura Tess e depois de discutirem verbal e fisicamente, Lana faz uma revelação sobre Lex que deixa Tess para lá de surpresa. O detetive John Jones é gravemente ferido por um tiro. Intrigado com isso, Chloe sugere que Clark se disfarce de policial! Infiltrado na polícia, e atuando nas ruas com um parceiro, Clark terá a chance de desvendar quem ou o que explica o tiro em John. Como Lana ficará na cidade por mais um tempo, Clark a procura e a beija!

Jimmy continua internado depois do casamento. Clark é atacado por terrorista que o odeia, quando uma legião de jovens super poderosos o salvam! Na fortaleza, Chloe, possuída por Brainiac, prepara Davis para ser o apocalipse. Como salvar Chloe sem matá-la, já que seu corpo está sendo usado por Brainiac?

Lois Lane registra todos os movimentos que envolvem o casamento de Chloe e Jimmy! Oliver localizou Lana em cuba e está convencido que Lex está vivo. Davis, aflito liga para Chloe, e na sequência, mais uma vez se transforma e age como uma "fera"! Clark e Lois se entreolham e, dançam e quando iam se beijar Lana chega à festa! Antes de Chloe dizer sim para Jimmy, um monstro entra em ação e a leva embora!

Lois Lane aceita convite de Clark para voltar a morar no rancho Kent. Clark recebe um pacote misterioso que contém o cristal que Tess encontrou no ártico. Ao tocá-lo, Clark é transportado junto com Lois para a zona fantasma, onde ele encontra Kara. Ela abre o portal para libertar Lois, mas a esposa de Zod escapa junto e a possui. “Lois Lane" volta para terra com poderes para encontrar seu filho! Kara aconselha Clark a contar seu segredo para Lois.

Enquanto pesquisa o passado de Davis, ele tenta, mesmo às vésperas do casamento, convencer Chloe que Jimmy é o homem errado para ela! Chloe anda estranha, distante, distraída e esquecida, ou seja, muito fora do seu normal! Isso chama a atenção de Clark, quem logo descobre que a memória dela foi tomada por Brainiac! Desesperado, Clark pede a ajuda de Jor-El que o adverte que a única solução seria arriscada pois toda a memória real dela seria deletada (inclui-se aí o segredo de Clark). O que Clark decidirá?

Na sua incansável busca pelo herói da cidade, Jimmy acaba fotografando Clark em ação! A foto apenas mostra um borrão vermelho, o  que o impede a identificação. Clark recorre a Oliver para despistar Jimmy. Após despistar Jimmy, Clark tem pela frente a curiosa Lois Lane que está determinada a conseguir uma entrevista exclusiva com o super-herói de Pequenópolis!

A razão do trabalho de Chloe na fundação Isis é ajudar os infectados; por isso é difícil para ela aceitar que um deles possa ser responsável por cinco assassinatos na cidade, como acredita Clark! Jimmy investiga o bom samaritano, o herói misterioso, que tem agido na cidade. O paramédico Davis, novo amigo de Chloe, confessa a ela que ele sofre blackouts e por isso admite que pode ser ele mesmo o assassino à solta.

Chloe e Jimmy são sequestrados por um joalheiro louco que os submete à sessões de tortura que quantificaria o amor de um pelo outro! Para salvar a prima, Lois Lane e Clark se passam por um casal. Jimmy conta a verdade sobre sua família para Chloe.

Lois Lane critica Clark por continuar ligado a Lana. Jimmy, a duas semanas do casamento, encontra carta de amor de Chloe para Clark! Oliver envia presente para Tess Marcer.
Uma "beijoqueira assassina" se apresenta como Máxima, rainha do planeta Almerac, que veio à terra à procura de um homem criptoniano! Quando ela cruza o caminho de Clark, os dois se sentem muito atraídos.

Oliver chega à festa que ele mesmo organizou passando mal: ele diz que foi envenenado e que só tem 12 horas de vida! Lois Lane está abalada ao reencontrar Oliver agonizando! Enquanto devaneia, Oliver tem flashes com sua ex-namorada numa ilha: Tess Marcer! Chloe, após abandonar sua carreira de jornalista, assume a direção da fundação Isis.

Lois Lane cuida pessoalmente do visual de Clark para seu primeiro dia de trabalho no Planeta Diário! Na sequência, uma explosão leva Clark a socorrer pessoas feridas, dentre elas a poderosa Tess Marcer. Dentre as vítimas também está uma garota de 15 anos, Betty, quem Chloe acolhe em sua casa e logo descobre que o acidente teve ligação direta com Betty! O paramédico Davis tenta se aproximar de Chloe, mas ela já se apresenta como noiva.

A bela Tess Marcer se apresenta como presidente da Luthorcorp, por ordem de Alex! Daí então paira a dúvida: Onde estará Alex?! O Arqueiro Verde outros amigos da Lia procuram por Clark; visto pela última vez no ártico! Chloe, supostamente por ter invadido os computadores da Nasa no passado, agora é presa pelo governo para "estudos". Lois Lane se infiltra na prisão para tentar resgatar a prima! Clark, quase morrendo, é resgatado por Arqueiro Verde. Chloe e Jimmy se reencontram e ela, enfim, diz sim ao pedido de casamento feito por ele. Clark será estagiário no Planeta Diário, respondendo diretamente à Lois Lane!

Clark se depara com um imbatível ser da zona do fantasma, o cruel Bizarro, que se disfarça num clone do próprio Clark! Bizarro apronta por toda cidade se passando por Clark, até canta Lois Lane! Lex vê uma bela moça (que voa!) Enquanto delirava; é acusado da suposta morte de lana e vai preso! Clark "ressuscita" Chloe, praticamente morta no hospital! Lana está vivendo em Shangai!! Bizarro pede a ajuda de Lex para "pegar" Clark! A fraqueza de Clark é a força de Bizarro!! Clark não sabe como derrotá-lo!!!

Clark decide ir embora depois do enterro de Lana; mas ao se deparar com uma nave próxima à represa, muda de idéia! Clark conhece a bela loira, Kara, e descobre que se trata de sua prima, há 18 anos fora de krypton, enfim alguém de sua "família"! Ela está desesperada pois sua nave foi "roubada" por humanos e se, alguém a abrir pode ativar uma seqüência explosiva!! Lex é solto e inocentado pela morte de Lana; mas ele não acredita que ela está morta! Novo editor do planeta diário se encanta com Lois Lane e a contrata! Lionel Luthor está desaparecido! Lex localiza lana na Ásia!

Fascinada com a vida na terra, Kara quer fazer amigos; mas Clark a adverte para não se expor com seus super poderes....Tudo em vão!! Kara se envolve num perigoso concurso de "Miss Pamonha" e vence!! Kara se interessa por Jimmy, namorado de Chloe! Lana reaparece em Smallville e conhece Kara! Lex diz que quer conhecer a prima de Clark!!

Ao saber que um médico, Dr. Knoxx, era capaz de curar infectados, Chloe se empolga e marca uma consulta com ele! Mas, ele também estava a serviço de Lex Luthor!! Lana e Kara estão escondidas no rancho dos Kent! Kara continua paquerando Jimmy; e Chloe percebe! Clark salva Lex mais uma vez!!

Pequenópolis está agitada por conta de um filme que está sendo rodado lá. Chloe e Clark vão até o set e, numa cena de ação o carro da atriz principal, Rachel, perde o freio e Clark a salva! Depois de se recuperar do choque, Rachel insiste em agradecer Clark e, aproveita para paquerá-lo! Kara continua desaparecida. Lex localiza o pai amarrado numa cama, feito refém por "alguém" que ele não revelará para o filho!

Kara viaja para Washington em busca do cristal, mas é capturada e sedada. A droga faz com que ela relembre uma viagem anterior à terra, quando ela seguiu a mãe biológica de Clark, Lara, até a fazenda Kent. Clark a salva, mas também acaba vítima do mesmo soro que a sedou e vê sua mãe através das memórias de Kara. Chloe descobre que Lana é a dona da fundação Isis! Lionel está de volta e ameaça Lana!

Em meio a uma tempestade Lana toca numa criptonita verde e daí então se torna forte e veloz como Clark! graças a estes poderes Lana quer deter o novo projeto secreto de Lex! A poderosa Lana, com seu lado sombrio e o ódio despertos está em busca de vingança!! Lex que se cuide!

Lex "joga" com Grant e o obriga a terminar seu relacionamento com Lois Lane! Grant revela que é irmão de Lex. Kara reaparece sem memória em Detroit! A bela mãe biológica de Clark, Lara, chega ao futuro por um portal e presenteia o filho com um anel de criptonita azul. Ao usá-lo Clark perde seus poderes e só aí percebe que sua mãe era a isca perfeita para Zor-El enfraquecê-lo e dominar a fortaleza da solitão!

Lois Lane e seu chefe, o editor Grant continuam se vendo secretamente! Lex compra o "Planeta Diário". Grant descobre que ele é um "clone", criado em laboratório para Lex ter um irmão (o tal projeto Gemini)! Clark retorna da fortaleza da solidão e diz a Lana que Kara se foi e que precisam deter Lex. Por isso ela lhe conta tudo o que descobriu e sobre a "visita" do misterioso Adrian, Que foi infectado por uma substância desconhecida. Adrian secretamente planta uma bomba em Chloe e diz a Lois que se ela não conseguir que Lex admita a verdade sobre o experimento 33.1 Ele detonará a bomba. Chloe, pensando que morrerá, confessa a Jimmy que é uma das infectadas pela chuva de meteoros.

Grant desobedece Alex e procura Lionel Luthor e conta que é seu "filho"! Clark preso na fortaleza, enquanto bizarro assume sua identidade em Smallvile e "curte" a companhia de Lana e colhe informações importantes para ele! Inconformado com a desobediência de Grant, Lex o demite e, após jantar com Lionel, Grant é assassinado na saída do restaurante!!

Enquanto trabalha para o flecha verde, Chloe intercepta um arquivo de um dos projetos de Lex, mas é atacada por uma mulher com visual negro e misterioso (era a Canário Negro!). Lex convence a Canário Negro a capturar o arqueiro verde e sua equipe acusando-os de terroristas! Clark tenta convencê-la do contrário! Lionel pede a Chloe que o ajude a incriminar Lex no caso da morte de Grant! Lois Lane descobre o segredo do arqueiro! Crise na relação entre Lana e Clark...Ele com ciúmes de tudo que ela "viveu" com seu Clone!!

Lois Lane segue Lex e descobre que ele localizou Kara (ainda sem memória) na periferia de Detroit! Um homem, desequilibrado, obcecado pela beleza de Kara, a faz refém e ao perceber que a "perderia", atira na cabeça de Lex Luthor!! Como localizar Lois e Lex? Lionel e Chloe se unem num perigoso desafio!!

Kara, ainda com amnésia, e Jimmy vão a um concerto do One Republic e cruzam com o ex-morador de Smallville Pete Ross. Pete mastiga um chiclete enriquecido com kryptonita verde e desenvolve super-poderes. Clark e Chloe ficam felizes ao rever o velho amigo, mas o avisam para não usar seus poderes em público. Num rompante Pete confessa que abandonou sua própria vida para proteger Clark e agora, com seus poderes está se sentindo um herói, como Clark! Lex descobre os poderes de Pete e o Chantageia para ajudá-lo a abrir um cofre de Lionel (onde estava a pulseira de Kara!) ameaçando revelar que Chloe é uma mutante de meteoro.

Kara confia apenas em Lex e até se muda para sua mansão! Por uma razão misteriosa Lionel sequestra  Clark em uma cela de kryptonita e, questionado por Chloe e Lana ele diz que suspeita de Lex. Por isso Chloe e Lana levam Kara para a fortaleza e imploram a Jor-El para restaurar a memória dela já que ela é a única esperança para salvar Clark. Enquanto preso Clark é visitado por Patty, filha do Dr. Swan, que lhe faz revelações perigosas!

Lex se lembra de tudo que aconteceu no dia da chuva de meteoro e culpa o pai de tê-lo sacrificado pelo viajante! Por isso o ameaça e exige a segunda chave que precisaria para abrir uma tal caixa com o segredo do viajante, guardada na Suíça! Na recusa da entrega da chave, Lex atira o pai do alto de um prédio! Lana está cega num sanatório! Clark lê um recado de Lionel sobre a urgência de localizar as duas chaves para manter seu segredo a salvo! Jimmy tem foto de Lionel caindo do prédio!! Lex enterra o pai sozinho!

Chloe assume a direção do instituto Isis, enquanto Lana está no sanatório! FBI procura Jimmy pois Chloe teria invadido os computadores do governo e agora ele será um espião da polícia ou será preso! Sem saída, Jimmy recorre a Lex, que livra Chloe dos problemas com a justiça mas faz de Jimmy mais um de seus "devedores"!! Enfim Lex vai para Suíça e abre o tal cofre. Desesperado para salvar Lana, Clark se arrisca indo até a fortaleza enfretar Brainiac!

Clark descobre que Kara, no passado, enviou mensagens de Krypton avisando que Brainiac queria matar o bebê Kal-El, ou seja. Ele mesmo!! Com toda esta situação, Clark se vê confuso e achando que seria melhor para todos se ele nunca tivesse chegado à Smallville! Como seria a vida sem Clark? Lex seria presidente dos EUA; Lana estaria casada e feliz...etc...Assim Clark passeia entre os personagens como alguém comum...

Lex é atacado por um estranho encapuzado que deixa símbolos kryptonianos em seu peito. Chloe e Clark investigam e descobrem que um membro do clã Veritas sobreviveu e está se escondendo na igreja de São Cristóvão, no Canadá. Clark e Lex correm para ser o primeiro a encontrar esse membro misterioso de Veritas! E nem o clima do templo ajuda a controlar os ímpetos malévolos de Lex!

Kara diz a Lex que ele está destinado a derrotar o viajante e se oferece para levá-lo até a Fortaleza. Clark fica decepcionado com Kara, mas descobre que Brainiac está controlando-a e que a verdadeira está presa na Zona Fantasma. Pouco depois de ser pedida em casamento por Jimmy, Chloe é presa pela polícia! Lana acorda de seu estado de coma e deixa, num vídeo, uma mensagem de adeus para Clark! Lex "cobra" de Jimmy sua "dívida" através de informações sobre Lois Lane! Num duelo na Fortaleza, Lex descbore quem é Clark!!!!

Clark encontra-se preso, sem poderes e cercado de criminosos na "zona fantasma" criada por seu pai biológico, enquanto Pequenópolis é destruída e Lana implora a ajuda de Lex (agora o super poderoso Zod!!). Após sobreviver ao acidente aéreo Martha é surpreendida com a "visita" de Jor-El para explicá-la como matar Zod ... Ou será o fim do nosso planeta!!

Depois de conseguir fugir da zona fantasma e ajudar a recuperar a destruída Pequenópolis, Clark está resfriado...O primeiro de sua vida!! E por isso, ao espirrar, causa um "estrago" grande por conta do poderoso "sopro" que emite! Por quase ser atingida pelo portão do celeiro dos Clark, Lois está muito intrigada! Após ser raptado Lex diz se sentir seguido por alguém e com perda de parte da memória....Seu pai desconfia!!l Ana se muda para a mansão dos Luthor!

Chloe e seu paquera, Jimmy, namoravam quando ouvem um barulho e encontram o corpo de uma garota que suspeitam ter sido morta pelo namorado! Clark terá muito trabalho para descobrir quem cometeu este crime! Sentindo-se culpado por tudo que causou à cidade, Lex promove um super baile beneficente! Lana se "entrega" a Lex! Lois Lane conhece Oliver, um jovem  rico e bonito!

Lionel Luthor acompanhava a senadora Martha numa festa de poderosos, quando o valioso colar que a senadora usava foi roubado! A determinada Lois Lane viu que alguém vestido de verde estava na "cena", e intrigada, quer desvendar a face do mesmo...ainda assim outras pessoas ricas da cidade têm sido assaltadas!! Lionel pede a ajuda de Lana para evitar que Lex destrua o mundo!

Lex recorda quando era garoto seu convívio difícil na escola, inclusive Oliver fazia parte da sua turma, ou melhor, da turma dos que o faziam sofrer com o "bullying"! Na tentativa de se tornar aceito pelos colegas, Lex se envolve num obscuro "desaparecimento" de um colega chamado Duncan! Nesta grande reunião de ex-alunos, a expectativa é saber se Duncan virá ou não!! Lex e Oliver se enfrentam! Clark teme que mais seres tenham aproveitado sua fuga, para sair também da zona fantasma!

Lana é avisada que corre perigo por se aproximar da família Luthor! As suspeitas de Clark se confirmam:  Raya, uma fugitiva da zona fantasma, está em Smallville! Também na cidade está outro criminoso foragido da zona fantasma que culpa o pai de Clark pela sua prisão e quer se vingar!! Jimmy, o namoradinho de Chloe, investiga demais para os padrões de Lex e por isso perde o emprego!

Lois está namorando Oliver (e desconhece sua verdadeira identidade - o arqueiro verde!). Clark está preocupado com a mudança de atitude de Oliver, pois está muito "forte" e violento ! Qual seria a razão? Chloe e Clark investigam! Lana passa mal e descobre que está grávida!!

Lex sumiu...onde estaria?? Lana está preocupada com o desaparecimento de Lex e porque não sabe se conta ou não sobre a gravidez para ele! Na realidade Lex estava invisível às pessoas e preso numa outra freqüência, o deixa mais "humano", sobretudo, quando descobre que será pai! O perigo ronda a vida de Lex quando um ex-paciente foge dos laboratórios Luthor e faz Lana refém para se vingar de Lex!!

Ao acolher um garoto fugitivo e assustado na fazenda, Clark descobre que seu vizinho recruta imigrantes clandestinos e os transforma em escravos! Mais indignado ficou ao saber que um amigo do garoto havia morrido na fazenda de uma forma muito estranha: tragado pela terra! Como? Mesmo contrariando sua mãe, Clark protege o garoto!

Chloe se indispõe com uma poderosa jornalista do planeta, linda Lake, por artigos sem provas sobre um esportista que ela tem publicado! Misteriosamente, toda a conversa entre Lana e Chloe sobre suas dúvidas em responder sim a Lex e seus sentimentos por Clark se tornam manchetes do planeta! Intrigada com o que aconteceu Chloe investiga linda Lake! Enquanto isso Lois Lane está convencida que Oliver é o arqueiro verde e pede a ajuda de Clakr para desmascará-lo!!

Oliver e Lois Lane aos beijos planejam viagem para Monte Carlo! Enquanto isso, um ex-paquera de Chloe, que Clark descobrira ter poderes no passado, volta a Smallville como um dos correligionários de Oliver, o arqueiro verde, na missão de impedir que Lex Luthor desenvolva, nos seus laboratórios, um exército de mutantes! Este grupo de super heróis, convida Clark para integrar a liga! Chega ao fim o romance de Lois e Oliver!

Clark está vivendo um surto psicótico, num mundo onde está sem poderes, confuso....Onde Chloe também está internada num manicômio ! Neste seu mundo mental, Lana opta por ele, ao invés de Clark, e, por amor, implora para que ele continue internado em tratamento! A saída deste mundo é uma metáfora ao seu mundo real que exige dele uma decisão!!

Numa festa esotérica, Lois Lane experimenta um baton vermelho (feito de criptonita) que a faz desejar Clark! e ao beijá-lo , o "poder" da criptonita deixa Clark totalmente desinibido e por isso ele vai à festa de noivado de Lex e Lana e diz tudo o que pensa sobre os convidados! Preocupada com o que está acontecendo Chloe investiga a origem do "baton" ...E ainda enfrenta crise de ciúmes de Jimmy!!

Jimmy acaba o namoro com Chloe pois acredita que ela ainda ama o amigo Clark! Lana, enquanto Lex viaja, recebe ligações misteriosas e fotos que demonstram que alguém a segue de perto! Preocupado com a segurança de Lana e do assédio da imprensa pela proximidade do casamento, toda a equipe de seguranças dela é reforçada! Mas nada parece afastar o perigo de Lana, por isso, ela decide se "esconder" na casa de Clark! Mas ainda assim o perigo continua a ameaçá-la!! Clark tem que entrar em ação para salvar sua amada!

Lana faz sua despedida de solteira apenas com Chloe! Clark e Chloe descobrem que um ex-colega de colégio, Tobias, atualmente cego por causa da chuva de meteoros, tem a "habilidade" de identificar pessoas "infectadas" e está sendo usado por Lex! Temendo que Clark seja "identificado" por Tobias, Lana o oferece um transplante de córnea! Mas antes disso ele consegue identificar Chloe como uma identificada e por isso ela é sequestrada! Clark desesperado entra em ação para ajudar a amiga!

Enquanto Chloe, como madrinha, acompanha a decoração da igreja para o casamento de Lana. O médico dela procura Lex, ameaçando contar a Lana toda a verdade sobre sua gravidez! Lex, coagido, toma uma drástica atitude! Lionel promete ao filho que Lana estará no altar e se casará com ele! Enquanto Lana é tomada pela dúvida sobre seu casamento, Clark a procura decidido lhe contar seu segredo e impedir que ela se case!

Ainda triste com o casamento de Lana, Clark localiza um clube de luta criptoniana na Internet! Enquanto Chloe o ajuda a rastrear o site, pessoas morrem lutando! O atual campeão da tal luta é "Titan" - o matador - um fugitivo da zona fantasma! Em busca de uma matéria "quente", Lois Lane segue as investigações de Chloe sobre o clube da luta e se dá muito mal! Para tentar deter Titan, Clark decide encará-lo no ringue! Enquanto isso Lana passa mal e parece perder o bebê!

Lana, infectada, agride Lex e mais tarde vai parar no hospital e descobre que nunca esteve grávida!! Enquanto isso, Chloe e Clark descobrem que a mãe de Chloe, Moira, está presa numa clínica de Lex Luthor pois ela tem "poderes"  capazes de controlar os "infectados"! Revoltados com a situação Clark e Chloe tentam salvar Moira mas Lex contra-ataca!

Desesperada a militar Jodi, esposa do capitão Wes "desaparecido" a serviço de Lex, exige que ele "apareça" com seu marido em 20 minutos ou a bomba que ela "armou" explodirá o laboratório secreto! Mesmo com todas as diferenças, Clark se arrisca entrando nos túneis onde, sem seus poderes, e achando que iam morrer, Lex e Clark trocam "verdades"!

Jimmy preparava uma sessão de filme Noir para sua amada, quando foi agredido por alguém e daí então, no sua imaginação assiste à Smallville e seus personagens nos anos 40! Porém os "papéis" são bem diferentes: Lana é uma mulher sedutora que planeja a morte do marido, Lex: Clark é um repórter; Lois Lane é uma cantora, etc... Enquanto isso, nos dias atuais, Clark descobre porque Lana se casou com Lex!!

O tal capitão Wes, por quem quase Lex morreu no episódio anterior, é o seu novo "brinquedo" !! Ele fazia parte de um "projeto" obscuro apoiado por um senador corrupto  "comprado" por Lex, que agora pressiona Lex! Na seqüência Lois Lane vê o tal senador ser assassinado por Wes! Ela o reconhece ...Foi seu primeiro namorado, e a presença dela deixa o "protótipo" fora de controle! Daí então Lois Lane passa a ser o próxima alvo de Lex! Martha é convidada a substituir a vaga do senador morto em Washington! Clark a apóia!

Lionel diz a Lex que Lana não o ama e que foi ele o responsável por ela ter subido ao altar! Lana diz a Clark que vai deixar Lex! Emocionado Clark conta tudo sobre sua vida e poderes e ela conta a verdade sobre seu casamento! Nervoso com o que ouviu, Clark procura Lionel para "acertar as contas"! E mais uma surpresa o espera...Logo depois de por fim ao seu casamento Lana sofre um atentado! Lois Lane está cada dia mais determinada a se vingar de Lex por causa da morte de Wes, se arrisca tanto que acaba fatalmente baleada! Será a chance de enfim Chloe desenvolver seus poderes especiais também?!

Enquanto Clark, na fortazela da solidão, discute com Jor-El para voltar à Smallville, ouve o pedido de socorro de Chloe que também está congelando na mesma fortaleza gelada! Depois de muita insistência , Jor-El autoriza Clark a socorrer Chloe contanto que volta antes do por-do sol! Enquanto isso Lana vê dois aliens chegarem de nave e destruirem toda a cidade à procura de Kal-El! Ao ser salva Chloe confessa que sabe sobre os poderes de Clark! Oor desobeder Jor-El, Clark é punido!

Por conta da sua desobediência, Jor-El "pune" Clark transformando-o em um simples mortal, sem poder algum! Feliz com a condição de ser humano "normal", Clark retoma seu relacionamento com Lana! Enquanto isso alguns internos do sanatório b. Heaven, também com poderes, fogem para Pequenópolis para "conhecer" o lendário jovem Clark Kent! Para isso fazem os pais do rapaz seus reféns!! Como enfrentá-los sem seus super poderes?

Chloe tenta conter Gabriel, um perturbado ex-colega de jornal, que aponta um míssil para Pequenópolis! Em uma hora a cidade desaparecerá! Lana e Clark são flagrados acordando juntos pelos Kent e isso os deixa furiosos! Num momento de descontrole, Chloe amarrada, Gabriel atira em Clark que acaba "morto" no hospital! A curiosidade fica pela transferência dos poderes de Clark para Lionel Luthor! Nas mãos de Jor-El Clark tem que negociar sua "volta" ao nosso planeta!

Lois Lane está de volta à Pequenópolis e, acompanhada de Clark e Lana, vai curtir uma praia! Ao mergulhar, Lois Bate a cabeça e desacordada se afoga! Ao tentar socorrê-la, Clark flagra um rapaz salvando-a numa velocidade superior à sua! Intrigado com o rapaz que se apresenta como Arthur, Clark e Chloe pesquisam sobre a vida do rapaz! Arthur confessa a Clark porque é um "homem-peixe" e o que faz em Pequenópolis e acaba em apuros! Clark decide ser assistende de pesquisa de seu novo professor, Sr. Fine, quem está escrevendo um livro sobre a Luthorcorp!

Chloe está pleiteando uma vaga de estágio no "planeta diário"! Lana foi aceita na universidade de Metrópolis, mas não contou pra Clark! Lana é "aceita/atraída" numa irmandade da universidade formada somente pela mais ricas, bonitas e melhores garotas; mas na realidade, são perigosas vampiras que tomarão lana para si!!

Chloe, à 1:00 da madrugada, atende à uma ligação no planeta diário de uma mulher desesperada pedindo que um jornalista a encontrasse! Chloe vai socorrê-la mas assiste ao seu atropelamento e morte! Acompanhada de Lois Lane, Chloe se envolve no caso! Enquanto isso Sr. Kent recebe a visita do velho amigo e senador Jake, pedindo-lhe apoio na campanha, pois já sabe que terá Lex Luthor como seu rival nas eleições! A tal garota atropelada era uma stripper e uma foto dela com o senador levará Lois Lane a se disfarçar de stripper enquanto Chloe e Clark investigam o caso! Seria uma armação de Lex contra seu rival?

Lana recebe uma pedra de meteoro (prateada), supostamente enviada por Lex Luthor como presente! Ao mostrá-la para Clark, este "corta" o dedo e "sai correndo"  pois se tratava de uma criptonita! Desde então Clark começa a ver, ouvir e  concluir coisas: a paranóia toma conta dele e de sua força! O professor Fine se revela criptoniano a Clark! Lionel "entende" o motivo que leva Lex a concorrer ao senado!

Lex faz sessão de fotos para sua campanha no Taylon e se desentende com Lois Lane! Enquanto isso a Sra. Kent desmaia depois da aparição de uma luz intensa no céu. Marta cai doente e começa a aparecer manchas em seu corpo, que segundo o professor Fine, seria um sinal do "pai" de Clark! Desesperado Clark acredita no professor e vai ao encontro de seu pai biológico, tentando salvar a vida de sua querida mãe!

Preocupado com a performance do Sr. Kent na campanha, Lex se envolve num tiroteio e acaba no hospital
Correndo risco de perder os movimentos da cintura para baixo. Caberia a seu pai decidir se ele seria ou não submetido a uma perigosa cirurgia. Aflita com a quantidade de presentes que ainda tinha para entregar  (2000!) e, com os motoristas em greve, só resta a chloe apelar para seu amigo super veloz para dar um apoio a papai noel!

Sr.Kent e Lex Luthor já estão em plena campanha para o senado do Kansas! Enquanto Sr. Kent recebe ligações anônimas e ameaças sem revelar a ninguém, Lex organiza um núcleo de jovens correligionários! Dentre eles está Samanta, uma jovem obcecada por Lex, que será capaz de qualquer coisa para levar Lex à vitória! Enquanto isso, Clark enfrenta problemas "sexuais" e por isso se distancia de Lana, que não entende o que está acontecendo!

Dois policiais que sobreviveram à última chuva de meteoros e assistiram seus companheiros morrerem, querem se vingar e lembram que Lex teria se apoderado da tal nave, que Lana também vira na ocasião! Com muita violência eles invadem a mansão de Lex e fazem dele e Lana reféns! Enquanto isso Sr. Clark pressiona Lois Lane para saber a origem do dinheiro que ela está gastando na campanha!

Num rompante de "verdade", Clark conta a Lana sobre todos seus "segredos", e embora em choque, Lana ainda é pedida em casamento! Clark está muito ansioso aguardando a resposta dela! No mesmo dia há uma grande festa para acompanhar a apuração dos votos que levarão Sr. Clark ao senado! Nesta festa Lana dá seu "sim" a Clark e, sem que ele notasse, vai até a mansão de Lex, atendendo a um chamado do amigo! Os fatos daí então reservados à Lana, explicarão o perigo a que ela será exposta por saber o segredo de Clark!! Diante da chantagem de Lionel Luthor, o recém eleito senador morre!!

Clark ainda sob o efeito do luto pelo pai, não atende ao pedido da mãe que queria que ele ficasse com o relógio do pai! Para sua angústia, sua mãe é assaltada em Metrópolis e levam o tal relógio; porém uma mulher mascarada e com super poderes faz as vezes de justiceira e socorre Marta! Clark e Chloe descobrem quem é a  "mascarada"  e ela os ajuda a procurar o relógio! Marta foi convidada a assumir o cargo de senadora no lugar do marido; mas ainda não se decidiu!

Chloe, no banho, corta os pulsos!! Ela diz que não sabe o que aconteceu e ao ser encaminhada para o hospital quase acaba internada no manicômio! E para piorar as visões que teve no banheiro de casa de uma moça lhe pedindo ajuda, persistem! Quem era a garota? O que queria? São questões que Clark, Lois Lane e Chloe tentarão descobrir! Marta decide aceitar o cargo de senadora!

Vitor, colega de escola de Clark, supostamente morto, reaparece graças a ajuda de um médico oriental que o liberta de um projeto da luthorcorp que o transformava em meio-homem, meio-máquina (Cyborg!). Na fuga Vitor, um homem de lata, "atropela" o carro de Lana! Agora senadora, Marta recebe um vídeo "acompanhado" de chantagem e Lionel se dispõe a ajudá-la!

Lana convida Clark para passarem a noite juntos, mas ele desconversa! Chateada com a situação deles, Lana procura Clark e acaba flagrando-o aos beijos com uma garota que conhecera no Talon chamada Simone! Como o comportamento de Clark está muito diferente, Chloe investiga Simone e descobre que se trata de uma experiente hipnotizadora que tem um "forte" motivo para seduzir Clark! Obcecado com o paradeiro da nave, Lex vai para a América Central! Clark e Lana terminam o romance!

Lana, carente e desorientada com o fim do relacionamento com Clark, recorre a ausência dos seus pais como justificativa para injetar um coquetel, composto de meteorito, que a leva a morte e a ressuscita! Nesta "viagem" ela tinha contato com seus pais! Já viciada no tal soro, Lana está em perigo e, na tentativa de salvá-la, Clark acaba com o soro em suas "veias"! Assim Clark reencontra seu pai (Sr. Kent) que o avisa que Lionel já sabe seu segredo! Lionel aliás, está sempre por perto da senadora Marta! Enquanto isso Lex procura o Dr. Fine pela América Central!

A assessora de Marta, Naomi, é brutalmente assassinada! Naomi criava Maddie, uma garotinha de 11 anos, "muda" pelo trauma que sofrera aos 3 anos! Sem Naomi, Marta e Clark a levam para casa e lá descobrem que ela consegue, com a mente, controlar "vidros"! Enquanto isso Lana e Lex se beijam!! Lois Lane será  a nova assessora da senadora Marta!

Clark conta para sua mãe que acha que Lionel sabe sobre seus poderes! Em meio a fúria de um mascarado que ataca Lionel e o faz refém num perigoso jogo, Marta chega para checar o que ele sabe sobre Clark e acaba refém do violento "jogador mascarado"! Clark se desespera ao saber que sua mãe está correndo perigo por causa das loucuras de Lionel e parte para salvá-la ...mas Lex resolve acompanhá-lo! Lionel se revela a Clark! Lionel está em perigo pois alguém tenta matá-lo e para isso o faz refém.

Em Metrópolis Clark salva um homem que seria atropelado e agora quer recompensá-lo com grandes presentes. Clark flagra Lex e Lana juntos e se revolta com Chloe! O rico sobrevivente, Graham, tinha um estranho poder de se tornar invisível (e violento); e em prova de sua gratidão a Clark decide matar Lex!!

Marta, Chloe e Lois Lane preparam "bolinho" de aniversário para Clark! Neste dia Clark tem uma visão com seu pai, que ainda lhe dizia que Lionel faria algo terrível e para impedí-lo só se Clark o matasse! Confuso com a mensagem de seu pai, Clark pede ajuda a Chloe! Lionel está "em transe" escrevendo mensagens com sinais que não consegue entender... enquanto isso Lex convence Lana a acompanhá-lo numa mirabolante experiência, liderada pelo Dr. Fine, que viabilizaria uma poderosa vacina com objetivo duvidoso!

O anúncio da chegada de "Zod" se concretiza quando Lex, atormentado por um barulho, corre pelos campos e acaba levado pela nave, com a ajuda do prof. Fine! Preocupado com a chegada de Zod (um marginal que matou toda a raça de Clark e cumpria prisão, ameaça fazer o mesmo na terra), Clark procura Jor El, que lhe revela a existência de um hospedeiro que precisa ser destruído! De volta à Terra, Lex, dotado de extraordinários poderes, quer vingança e Clark é feito "prisioneiro"!

Clark está de volta à Smallville reprogramado como Kal-El, sem memória e indiferente ao sofrimento de seus pais! Pensando seguir seu destino, ele voa até os céus. Para tentar reaver o filho, Martha pede a ajuda do Dr. Swan que envia sua assistente Bridgette Crosby até o rancho dos Kent! Enquanto isso, a bela e urbana Lois Lane chega à cidade para investigar a morte de sua prima Chloe. Lana está em Paris comemorando seu aniversário com novo namorado, o dedicado Jason! Ao perceber que misteriosamente apareceu uma inscrição antiga em suas costas, ela resolve voltar para Smallville para tentar entender o que está acontecendo!! Jonathan continua em coma e Lionel enfrenta uma nova e amarga vida na prisão.

Clark e Lois Lane investigam a suposta morte de Chloe, mas são impedidos pelo pai de Lois, o misterioso general Sam Lane. Jason chega de Paris e convence Lana a continuar o relacionamento deles. Suspeitando que Chloe ainda esteja viva, Lionel envia um assassino com o poder de transformar seus membros em armas metálicas para impedir que Chloe testemunhe contra ele. 

Ali é considerada uma das garotas mais feias do colégio Smallville e, por todo conta deste trauma, ela se submete a um super tratamento experimental que sua mãe estetecista desenvolvera! O resultado do tratamento a deixou linda e todos a cobiçam! Mas sua beleza afeta todas as pessoas que ela beija, e ela decide que sua próxima vítima será Lana! Enquanto isso Clark decide fazer o teste para participar do time da escola, cujo técnico é Jason (quem continua a esconder o seu relacionamento com Lana)!

Depois de tanto esperar, chega a chance de Clark entrar em campo e, graças à sua brilhante atuação, o time se põe contra ele. Misteriosamente os jogadores do time estão agindo de forma super "obediente" à algumas garotas após tomarem uma "poção" conhecida entre as manipuladoras como " a molécula do amor"! Enquanto Clark tenta descobrir o que está acontecendo, Lex tenta recuperar sua amizade! Lois Lane parte de Smallville!

Lex insiste em reconquistar a amizade de Clark! Clark assiste seu pai quase ser atropelado por um carro descontrolado e, na seqüência, salvo por um garoto que também furtou sua carteira. Clark percebe que o tal garoto era tão rápido quanto ele e, ao encontrá-lo, percebe que o garoto se chama Bart, ou raio humano, e que se atrai por uma confusão! o Tailon é reinaugurado sob a gerência da Sra. Kent! Lana conta a verdade sobre a misteriosa "tatoo" das suas costas a Jason!

Lex visita o pai na penitenciária! Clark atormentado por um zunido também vai até Lionel e, ao se cumprimentarem, uma estranha luz os envolve há uma troca de almas! Ao perceber que não tem mais os poderes, Clark relaciona o que pode ter acontecido e tenta correr contra o tempo!!

Clark tromba violentamente contra outro jogador e isso levanta suspeitas que ele poderia estar usando drogas! Enquanto isso um misterioso aluno de intercâmbio, trazido pela Luthor Corp, chamado Mikail, ameaça Cloe e faz uma aposta com Lex sobre sua permanência ou não em Pequenópolis! Lex questiona Clark o quanto ele está interessado em ter Lana! Jason é demitido e Lana acusa Clark por isso!

Lois Lane volta a Pequenópolis para o aniversário de 18 anos de Chloe. A festa rola no celeiro do rancho dos Kent! O problema todo será um livro antigo sobre a condessa Margaret que Lana comprou! Ele possibilitará que a condessa possua o corpo de Lana e, por uma poção também, enfeitice Chloe e Lane! A festa se transforma numa noite das bruxas!!!

Lex conhece uma moça e na mesma noite dorme com ela! Ao acordar se depara com a moça morta e ensanguentada! Lex acha que foi armação do seu próprio pai. Mas após aquela troca de "energia" Lionel teve seu rim curado e se diz uma nova pessoa! Lana se surpreende com a visita da mãe de Jason!

Jason foi a primeira das muitas vítimas que aparecerão com sintomas de stress neurológico em Pequenópolis! Em pouco tempo se descobre que havia uma relação entre as vítimas e um vazamento num experimento com pedras de meteoro na Luthor Corp. Lionel Luthor embora com autorização da justiça para deixar a prisão se confessa criminoso! Jason decide ir embora de Pequenópolis! Chloe encontra sua mãe!

Alegando estar totalmente curada (depois de ter tentado matar Lana!) Alicia procura Clark para reatar o "namoro". Ela garante a Clark que seus "poderes" estão sob controle graças a uma pulseira que o seu "médico" desenvolvera para controlar seus distúrbios psicóticos.clark vê em alicia a chance de ter um relacionamento verdadeiro com alguém que saiba sobre seus poderes! mas logo, já fora de si, alicia usa de subterfúgios que acabam levando clark ao altar!! enquanto isso lana decide ter sua primeira relação sexual com jason! Lex continua questionando a "mudança" radical de seu pai, que até decidiu criar uma fundação de caridade!

Clark e alicia chegam juntos ao Talon, o que não agrada em nada à Lana e Jason! Horas depois, em momentos diferentes, Jason e Lana são violentamente atacados por alguém. Naturalmente Alicia se torna a suspeita número um! Alicia jura inocência e apenas Clark acredita nela! Existiria um outro agressor? Alicia promete a Chloe provar que Clark é diferente de todos e por isso simula estar em perigo...Chloe assiste a tudo mas decide guardar o segredo! Mãe de Jason, Genevieve, pede ajuda a Lex para afastá-lo de Lana!

Na tentativa de recrutar o zagueiro Clark Kent para o time da universidade de Metrópolis, ele é apresentado ao time e ao mundo cheio de dinheiro e garotas que o esporte lhe proporcionaria pelo jogador Geoff, também de Pequenópolis! Lois Lane bebe demais numa festa da universidade e bate num jogador que, misteriosamente, fica quase morto. Intrigado com o fato Clark começa a investigar! Expulsa da universidade Lois Lane se muda para o racho dos Kent!

Clark recebe uma correspondência avisando sobre a morte do Dr. Swan e incluía uma "pedra" que o ajudaria a cumprir seu destino! Ao descobrirem por Lionel Luthor que Jason e Alex estavam em Shangai (procurando um artefato mítico por conta disso acabaram presos e torturados!) Clark e lana seguem para China! Os quatro se encontram num templo onde o artefato estaria escondido... mais uma vez Lana, ao ter contato com a tal pedra, Lana manifesta a bruxa francesa Isobel. A razão da viagem era encontrar a tal  "pedra"... quem terá pego a pedra??

Para surpresa de Lois Lane, sua irmã Lucy, que estuda na suíça, vem visitá-la em Pequenópolis. A bela Lucy encanta a todos mas logo Clark a flagra roubando!! Ela estava envolvida com perigosos agiotas que a seguiram e perseguiram até ali! Lex entra no caso pensando que ajudaria, mas isso só agrava o perigo da situação! Enquanto isso o apartamento de Lana é invadido e a tal pedra que disputaram na China é roubada. Jason acusa Lionel do roubo!

Durante um experimento na Luthorcorp uma explosão de criptonita provoca a divisão ( ou duplicação) de Lex Luthor em dois: o seu lado mais sombrio e mal personificado prende a porção "boa" na mansão. Assim o malvado e ganancioso Alexander usa palavras e atitudes grosseiras e violentas contra Lana, Clark e Chloe.

Chloe é indicada à candidata à rainha do baile de formatura. Ela disputará com mais duas, sendo a arrogante Dawn Stiles a mais interessada na coroa! Pouco antes do baile, Dawn sofre um acidente de carro e morre; mas seu espírito se transfere para o corpo da Sra. Kent, depois para inúmeras pessoas, possibilitando a ela se vingar de muita gente!! Lois Lane se oferece a acompanhar Clark no baile!!

Um garoto chamado Kevin Grady possui o poder de apagar a memória dos últimos dois minutos da vida de uma pessoa ... e ele usa isso em seu próprio benefício! Percebendo que Clark poderia ameaçar seus planos,
Kevin envia seus "raios" na direção de Clark deixando-o totalmente sem memória! Por conta disso, na companhia da fiel amiga Chloe, ele usa seus super poderes pois não tem nenhuma lembrança do que isso pode lhe causar! E em plena amnésia, ao se deparar com Lana, seu coração responde! Lana praticamente acaba o namoro com Jason.

Lana e Clark passando por uma região distante da cidade testemunham um clarão seguido de um grande fumaceiro! Lá encontram um lindo bebê chorando, que logo se apega muito a Lana e especialmente a Clark! Mas o bebê em poucas horas se transforma num garoto de 7 anos! Isso os faz procurar desesperadamente o pai do garoto pois ele tinha uma constituição genética incomum o que o envelheceria logo! Enquanto isso Genevieve cobra de Lionel o paradeiro da "pedra" da china!

No último dia daqueles quatro anos de convivência e estudo no colégio Pequenópolis, Clark e Lana recordam os bons momentos que viveram ali! Genevieve e Jason ameaçam matar Lionel e Lex para que entreguem a tal pedra da China que supostamente estaria com um deles. Enquanto isso o psicótico fotógrafo do "a tocha" vai aprisionando uma a uma das mais belas garotas do colégio. Clark decide estudar numa universidade próxima à Pequenópolis para continuar ajudando seu pai na fazenda. Lana decide ficar em Pequenópolis!

Clark tem um pesadelo avisando-o que uma nova chuva de meteoros se dirigia para Pequenópolis! Preocupado, Clark se dirige a caverna para com uma das suas pedras "provocar" respostas que só seu pai biológico, Jor El, poderia lhe Dar.Chloe o flagra na caverna e tenta protegê-lo de Lex! Ao mesmo tempo Lana é ameaçada por Genevieve por causa da pedra da China, e numa luta física, a pedra "enfeitiçada" leva Lana a matar Genevieve!e enquanto a chuva está cada vez mais perto: Lex decide proteger Lana juridicamente e Jason volta para se vingar de Clark!

Com uma passagem de tempo de três meses, Clark, sob o efeito da criptonita, está vivendo perigosamente em Metrópolis, onde se envolve com o rei do crime Morgan Edge, que o contrata para invadir a Luthorcorp! Longe de Pequenópolis, Clark muda seu nome e sua atitude diante do mundo! Enquanto isso, desesperado em reunir novamente sua família, Jonathan toma drásticas atitudes para trazer Clark de volta para casa. E na mansão, Lionel acusa Helen de ter matado Lex.

Lex, até então desaparecido numa queda de avião, onde só Helen sobrevivera, reaparece em Pequenópolis e vai tentar descobrir o que realmente "quem" estava por trás do tal "acidente" que o afastou por meses da civilização! Inconformado com a nova atitude violenta e perigosa de Clark, seu pai, Jonathan, usa seus meios para "conversar" com o pai biológico de Clark e faz um acordo para tentar reaver o filho!!

É hora de voltar às aulas! Lana nadava sozinha na piscina quando é atacada por Jake, quem, na hora, é morto por um misterioso atirador! C0omeça aí mais um mistério para Clark investigar! Mal sabia ele que também seria alvo do incógnito atirador! Enquanto isso Cloe tenta se livrar do "acordo" que fez com Lionel Luthor mas percebe que não terá outra chance a não ser continuar a ter uma vida dupla sobre Clark!! Lex volta à empresa do pai!

Clark sonha que está sendo perseguido por uma garota assustada que precisa de sua ajuda, que logo descobre que se tratava da sua nova vizinha que estava em coma há anos e pedia socorro através de "sonhos" ( ou visões!). Desta vez Clark pede ajuda a Lana ( e não a Cloe como costumava fazer!) Para descobrir a verdade. A tensão entre pai e filho agrava quando Lionel pede que Lex passe por uma avaliação psicológica completa, antes que ele seja contrato para trabalhar novamente na Luthorcorp!!

Perry White,  um jornalista decadente graças à ação destruidora de Lionel Luthor, chega em Smallville à procura de histórias de extraterrestres. Apesar de estar sempre bêbado, Perry testemunha Clark usando sua extraordinária velocidade. Daí  então planeja um perigoso plano para expor os super poderes de Clark. Enquanto isso, Lex descobre que Perry tem importantes provas das maldades feitas por Lionel no passado.

Dexter Mc Callum , tio-avô de Lana, condenado por assassinar sua esposa há 40 anos, mostra a Lana a foto do homem que ele acredita tenha sido o verdadeiro responsável pela morte de sua tia, e ela fica impressionada com a semelhança entre o homem da foto e Clark. Convencido de que esse homem é Jor-El, Clark, com suas investigações, chega a um medalhão de criptonita que o permite ver alguns fatos do passado que teriam ligação com sua própria vida!!

Lana repentinamente fica atraída por um ex-aluno da escola, e se transforma numa garota rebelde a ponto de ir parar na cadeia! Intrigado e com ciúmes Clark descobre que o novo namorado de Lana tem poderes magnéticos que podem mover objetos e alterar as emoções humanas. Enquanto isso, Lex descobre que Chloe está investigando o passado de Lionel, e tenta convencê-la a se unir à ele para enfrentar o seu pai!

Lex, na sua incansável investigação sobre o passado de seu pai, localiza Morgan Edge, um chefão do crime,  e tenta convencê-lo a admitir sua ligação com Lionel. Mas antes que Lex possa levar isso para as autoridades, alguém tenta matá-lo na mansão. Lutando para sobreviver, Lex foge e pede a ajuda de Clark. Mas quando Clark retorna à mansão, ele descobre que tudo está normal! Clark fica ainda mais intrigado quando Lionel o informa que Lex teve um ataque psicótico e será  internado numa instituição para doentes mentais!!

Lex se une a três vilões afetados pela criptonita para atrair Clark até o hospital psiquiátrico e pedir a ajuda dele para fugir, após descobrir que Lionel quer que ele passe pela terapia de eletro-choques para apagar sua memória. Enquanto isso, Lana conhece um misterioso estranho nas suas sessões de fisioterapia!

Tentando impedir um roubo numa joalheria , Clark acaba ficando temporariamente cego após utilizar sua visão de calor; por isso desenvolve uma super audição! Mas como aconteceu no início da descoberta de seus outros dons, Clark não consegue manter seu novo poder sob controle e o que "ouve" nem sempre lhe agrada!

Clark e Lana , cada um por sua vez e por razões então desconhecidas, tentam matar Chloe, logo após receberem um misterioso email do instituto Sommerholt. Clark descobre a fonte desses e-mails após Chloe revelar que tem provas sobre uma pesquisa de controle da mente do tal instituto. Isso explicaria porque mesmo demitida do jornal Chloe ainda era uma ameaça à tal pesquisa! Enquanto isso, Lana decide alugar o apartamento em cima do café para Adam, quem conhecera na fisioterapia, apesar de acreditar que ele está lhe escondendo algo perigoso sobre seu passado.

Clark descobre que Jordan, um colega da escola, pode prever o futuro, mas fica aterrorizado quando o garoto lhe diz que Lana vai morrer num incêndio nos próximos dias! Enquanto isso, Chloe começa a suspeitar de Adam (o novo inquilino de lana) e decide investigar o passado dele, descobrindo algumas surpreendentes informações. Clark encontra seu pai desmaiado no celeiro!

Pete se envolve no perigoso e marginal mundo dos "rachas"  que, por ingenuidade, se vê correndo risco de morte! Desesperado, Pete só tem a Clark para recorrer. Furioso por Pete colocá-lo nessa complicada situação, Clark tenta descobrir uma maneira de salvar seu amigo sem revelar seu segredo. Enquanto isso, Jonathan, ainda no hospital, se recupera do infarto. Porém Clark se sente culpado pois acha que os problemas de saúde do seu pai são conseqüências do acordo feito com Jor-El. E Lex descobre que o médico de Adam está lhe tratando com uma perigosa droga experimental.

Numa situação de perigo Clark não tem outra saída a não ser usar seus poderes na frente de Alicia, uma nova garota da escola, e fica surpreso ao descobrir que ela também tem seus próprios poderes!  Os dois desenvolvem uma nova ligação ao compartilharem seus segredos, mas as coisas tomam um estranho rumo após Alicia ficar obcecada por Clark. Enquanto isso, Lana pede para Lex investigar Adam.

Clark está preocupado com a saúde de seu pai que terá que se submeter a outra operação delicada. No hospital Clark conhece Garrett, um garoto que tem o irmão, Vincent, internado esperando por um transplante de fígado. Vincent morre mas misteriosamente dias depois aparece vivo e aparentemente saudável! Sua saúde logo se mostra frágil e para manter o irmão vivo, Garrett usa de meios extremos!

Clark está no centro de jovens de Smallville e atende uma linha de auxílio onde apavorado reconhece a voz de Lana pedindo socorro e em seguida ouve tiros! Clark corre ao encontro de Lana e constata que tudo está bem. Preocupado com a Amada, Clark relaciona os fatos e percebe que pertencem ao futuro de Lana e até quem atiraria contra ela!

Jonathan cai do telhado da casa e isso para Clark é uma conseqüência do pacto que ele fez com seu pai biológico há um tempo e por isso Clark vai até a caverna para tentar manter contato com Jor-El! Lionel o flagra na caverna e tenta juntar as "peças" procurando o cientista Dr. Virgil Swann (C.Reeve). Enquanto isso Lex fecha acordo com o F.B.I para "devassar" a vida de seu pai! Clark tenta se aproximar de Lana com um beijo!

Intrigada porque os currículos do seu pai (dispensado por empresa de Lionel) não são respondidos, Chloe "invade" a Luthorcorp e inspira acidentalmente um gás que faz com que as pessoas lhe digam só a verdade sobre tudo que ela quiser saber!! Uma arma para lá de perigosa se tratando de uma jornalista curiosa como Chloe...e Clark pode se tornar o alvo! Lana conta para Clark que irá embora para Paris!!

Para recuperar aqueles 7 dias de memória perdidos durante o "tratamento psicológico" a que seu pai o submeteu, Lex se arrisca numa experiência perigosa com o Dr. Garner. À medida que o tratamento avançava flash do passado perturbam Lex! Enquanto isso Lionel prepara uma armadilha pra Clark!

Lionel com seus cientistas estudam um místico punhal encontrado nas cavernas. Para ajudar na análise do instrumento, Lionel convida um mestre Kiwatche. Este estava acompanhado de um jovem professor universitário, também Kiwatche, que foge com a faca depois dela se revelar um talismã (com super poderes semelhantes ao de Clark) levando o jovem garoto acreditar que ele é o lendário Naman, "o homem que caiu das estrelas". Lana foi aceita para a faculdade de belas artes de Paris mas não tem dinheiro! Pete anda com problemas familiares!

Clark decide contar para Lana seu segredo quando soube que ela já estava com a data de embarque para Paris e a convida para um jantar; mas uma perigosa amiga de infância muda a agenda de Lana! Enquanto isso, um desonesto agente do FBI seqüestra e tortura Pete para tentar forçá-lo a revelar o segredo de Clark. Sob pressão Pete parte para morar com sua mãe em outra cidade. Além disso, o FBI também fecha o cerco a Lex para que prove os crimes que atribui a seu pai!

Kara, uma bela garota com super poderes, se apresenta a Clark como sua alma gêmea vinda de Kripton. Sua missão é convence-lo a cumprir o seu destino. Surpreso, Clark pede a ajuda dos seus pais e fica chocado quando Kara força Jonathan a finalmente revelar qual foi o acordo que ele fez com Jor-El. Além disso, Clark faz uma descoberta que irá mudar para sempre o seu relacionamento com Lex. Lana procura Clark para avisá-lo sobre a data de sua partida para Paris!

Clark resgata Lana de dentro de um furacão! Após a tempestade a cidade ainda se recupera e procura por pessoas, inclusive pelo pai de Clark, que, embora vivo ainda tentava se livrar do jornalista chantagista que descobrira toda a verdade sobre o Super Boy! Lex se depara com seu pai quase morrendo e hesita em salvá-lo. Cloe, mesmo insegura, propõe a Clark a retomada do relacionamento apenas como bons amigos...e para sua decepção ele concorda!!

De volta às aulas a turma se surpreende com a beleza e a sensualidade de Desiree, a nova professora de biologia! Mais surpresos ainda ficaram quando descobriram que ela era noiva de Lex Luthor!! Na sua primeira aula, a apresentação de um filme sobre educação sexual faz com que Clark, acidentalmente, incendiasse a sala!! Outros incêndios aconteceram até Clark, com a ajuda de seus pais, descobrir que o fogo tinha relação com seus impulsos sexuais!!! Desiree exalava um gás de sua boca que seduzia os homens e por isso consegue destruir os laços de amizade entre Lex e Clark, Lana, etc... enquanto isso lana tenta gravar uma mensagem para Whitney...

O Dr. Hamilton, pesquisador contratado por Lex para examinar as pedras de meteoro, está estranho e por causa dos processos que vem enfrentando Lex decide demití-lo. Descontrolado o Dr. Hamilton bate numa pick-up que é lançada no milharal...coincidentemente do lado da nave que "trouxe" Clarck!!! Na mesma estrada vinha Pete que salva a vítima e vê a nave! Naturalmente Pete chama Clark para ajudá-lo a remover a nave antes da chegada da polícia. Desesperado com a aproximação do seu passado, Clark tenta de todas as formas reaver a nave; mas a única saída seria revelar seu segredo para Pete!!

Clark resolve provar e compra um anel muito caro ( mas a pedra que encarecia o anel era falsa, na realidade era um pedaço de meteoro trabalhado) que o transforma num jovem muito rebelde e até agressivo com os pais; mas corajoso para seduzir garotas e até se confessar apaixonado por Lana. Pette e a família Kent vai ter muito trabalho para tentar recuperar o bom Clark!! Enquanto isso Lex se vê perdido com a decisão do seu pai (agora cego) se apoderar do seu escritório!!

Lana começa a receber bilhetes poéticos de um admirador secreto... Clark acha Piegas... o que deixa Lana muito decepcionada com ele! Enfim descobrem que o admirador secreto era um garoto que vivia amarrado no sótão pois sob o efeito da claridade se transformava num "monstro" violento! Lana e Clark tentam ajudá-lo e descobrem que a origem do mal que o perturba tem relação com a fábrica do Lionel Luthor, quem decidiu contratar Martha, a mãe de Clark, como sua assistente!

Uma mulher procura Clark se apresentando como sua mãe legítima. Ao perceber que ele não tem interesse em sua história, ela procura Lex e diz que Clark seria seu irmão, fruto do caso que teve com seu pai no passado! Para piorar a situação, a tal mulher consegue na justiça que Clark faça o teste de D.N.A.... Clark questiona porque Lionel Luthor participou de sua adoção e entende as razões que fazem seu pai odiá-lo!! Enquanto isso Lana também procura seu pai verdadeiro!

O garoto Ryan estava sofrendo com sangramentos e sua tia, sem dinheiro, confia seu tratamento a um inescrupuloso médico que o transforma em cobaia. Ryan consegue telefonar para Clark pedindo socorro! Começa assim uma desesperada busca pelo garoto e Clark, usando seus "métodos" de força, consegue resgatá-lo e acaba acusado de sequestro. Enquanto Clark se dedica à recuperação da saúde de Ryan , Lana enfrenta probçlemas de moradia e Lex se envolve na eleição para prefeito de Pequenópolis!

Lex anda com os nervos à flor da pele e até busca tratamento! Enquanto isso o crítico e exigente professor de metalurgia se torna uma vítima fatal de Ian. Enquanto a escola  se perguntavam onde estaria o professor; Ian se valia de seu poder de "clonar" para se aproximar Lana e Cloe e a cada uma, em particular, se revelar apaixonado! Clark , com ciúmes, tenta advertí-las, mas elas não lhe dão ouvidos!!

Enquanto Clark e Pete disputavam um "enduro" de moto, Clark cai numa caverna onde uma bela índia, Kaila, estudava as pinturas de seu povo. Assim Clark ficou sabendo que aquelas riquezas todas estavam ameaçadas pelo novo empreendimento dos Luthor! Clark e Kaila "ficam"! Enquanto isso a polícia investiga o envolvimento do avô dela, Joseph, com a misteriosa morte de um capataz dos Luthor! Cloe descobre que o significado do nome da tribo de Kaila é "mutantes" e isso será a pista para Clark solucionar os problemas que se seguirão!! Lana se alegra com a confirmação dos exames que confirmam Harry como seu pai biológico. Ao mesmo tempo corre para os braços de Clark para chorar o desaparecimento de Whitney!

O exército já enviou para mãe de Whitney alguns objetos pessoais do filho pois ele ainda continua desaparecido! Estranhamente Whiney aparece na escola, pouco depois de Clark ter convidado Lana para acompanhá-lo num passeio. Mas este (falso) Whitney era violento, estranho e ciumento e seu alvo é Clark! Lex fica irritadíssimo e agressivo com sua "paquera", a bela médica Helen, ao descobrir que seu pai tinha feito alguns depósitos na conta dela! Clark descobre quem era o falso Whitney!

Ao descobrir que seu pai havia minado a mansão com escutas e por isso pode passar-lhe a perna numa  mega operação, Lex não mede esforços e contrata profissionais para fazer o mesmo na sede da CIA. Onde seu pai estaria horas depois! Ao se depararem com um dos homens mais ricos do planeta, os profissionais se revelam assaltantes e fazem de Lionel Luthor e Marta reféns! ao arrombarem o cofre, Marta vê uma pasta que continha investigações sobre Clark, além da peça octogonal que pertence à nave de Clark! Este resgate humanamente parecia impossível; mas Clark entra em ação! enquanto isso Lana sofre ao ouvir da mulher de Harry, seu pai biológico, quão inconstante e como se comporta como pai!

Quando Lionel é baleado, Jonathan é preso, mas após Clark e Pete fazerem sua própria investigação na cena do crime, eles percebem que várias pessoas tiveram a oportunidade de matar Lionel, incluindo Lex. Enquanto a polícia encaminha o caso, Lana procura seu pai. Sr. Small, para defender Jonathan, mas se decepciona quando ele recusa seu pedido!!

Após Pete e Chloe serem infectados por um verme parasita na caverna onde Lex investiga as "escritas" que Clark também tenta decifrar, suas personalidades mudam. Pete usa a criptonita vermelha para fazer com que Clark se una a eles numa perigosa aventura, onde Lana flagra Chloe beijando na boca Clark, o que a deixa chocada ! Clark, fora de controle, exibe seus poderes na frente de seus amigos!!

Lex encontra seu irmão perdido Lucas, o filho que Lionel deu para adoção, e o leva para sua casa na esperança de que eles se unam contra o pai!! Quando a armação contra Lionel acaba colocando os três numa perigosa situação, Lex terá que decidir em quem ele realmente acredita. Lionel "volta" a enxergar!! enquanto isso, Clark decide aceitar um emprego no Talon.

Clark corre para tentar encontrar um antídoto após Martha ser infectada por um vírus tóxico e entrar em coma. No hospital Jonathan fica surpreso com a notícia que sua mulher estava grávida. Mas quando Clark também fica doente, Jonathan é quem terá que encontrar a cura. Para complicar ainda mais as coisas, a Dra. Helen (namorada de Lex!!) exige uma explicação de Jonathan quando ele se recusa a deixá-la cuidar de Clark. Desesperada ao ver Clark doente (dormindo) Chloe resolve ler para ele uma declaração de amor, que mais tarde será descoberta por Lana!!

Participação especial de Christopher Reeve, o Superman do cinema determinado a descobrir sua origem, Clark viaja para Nova York para encontrar o Dr. Virgil Swann, um rico e solitário cientista que tem um interesse especial com coisas extraterrestres. Clark fica surpreso ao descobrir que o Dr. Swann possui uma mensagem para ele de seu planeta natal. Enquanto isso, Lana decide se mudar da casa de Chloe após elas discutirem sobre Dlark enquanto estudam suas árvores genealógicas. Mãe de Clark está grávida!!

Clark acredita ter encontrado outra pessoa do seu planeta! Era Siros, um colega de escola que se diz alienígena e aparentemente usa sua visão de calor! Clark começa a investigá-lo e passa a acreditar que o garoto também veio do seu planeta natal, Krypton. Enquanto isso, após Helen (a médica namorada de Lex)  descobrir uma suspeita sala trancada na mansão dos Luthor e exigir saber o que há atrás da porta, Lex é forçado a revelar que ele está investigando Clark. E Martha teme sua gravidez e como o bebê foi concebido. 

Clark abusa dos seus poderes e acaba deixando um garoto, que tentava "agredir",  gravemente ferido!  Quando os Kents são processados por danos morais, o que pode custar a fazenda da família, Clark começa a questionar os seus poderes! Enquanto cumpre sua "pena" (varrendo a rua) Clark tenta encontrar uma maneira de impedir o processo. Enquanto isso, o ex-namorado de Helen chega à cidade e tenta reconquistá-la. Mas quando ela se recusa, ele acaba esfaqueando Helen, levando Lex a resolver pessoalmente esse incidente. Sentindo-se indefesa, Lana começa a aprender a lutar box sob a supervisão de Lex!!

Clark testemunha o roubo de um caminhão da Luthorcorp carregado de criptonita mas nem a sua força consegue deter os ladrões, curiosamente, muito fortes!! Um dos ladrões parecia ser um aluno do mesmo colégio de Clark! Para impedir que Clark vá até a polícia, os ladrões atacam Jonathan e Martha, fazendo com que Clark sinta-se impotente e fique desesperado na tentativa de encontrar uma maneira de proteger os seus pais. Enquanto isso, o relacionamento de Lana com o seu pai melhora, e a amizade de Clark e Chloe fica cada vez mais desgastada pelo ciúme que ela alimenta!

Lana começa a ver um fantasma de uma garotinha, amiga de infância, que morrera há seis anos afogada, Emily! Assustada, Lana pede a ajuda de Clark para descobrir a verdade sobre ela. Entretanto, após Clark descobrir que a pequena garota é na verdade um clone feito com a criptonita, ele corre para impedir que a garota consiga se vingar de lana. Lex descobre que Lionel está patrocinando a pesquisa da clonagem com criptonita. Enquanto isso, Jonathan começa a construir um berço para o bebê e Lex inicia os preparativos para o seu casamento.

Dr. Walden, o linguista que estuda as inscrições da polêmica caverna, acorda do seu coma e revela a Lex e Lionel que Clark é um alien e ele deve ser destruído!! Enquanto isso, Clark e Lana têm um promissor encontro romântico, até que Chloe descobre que os dois estão juntos, e Lana decide se afastar dele. Alguém invade o consultório da Dra. Helen e rouba uma amostra do sangue de Clark. Helen desconfia de todos, inclusive de Lex!! enquanto Dr. Walden, descontrolado, grita que o "dia está chegando", Clark é também atormentado pelas mesmas palavras e pelo o que elas podem representar para o seu futuro!! Enquanto isso Lionel Luthor tenta "comprar" Chloe!!

Clark "conhece" seu pai biológico com quem conversa e o adverte que ele não pode fugir do seu destino, que ele é o último filho de Kripton e a hora de deixar as pessoas (que ama) está chegando! Desesperado com o que ouviu e por se sentir sem opção Clark terá que escolher entre ficar com Lana e sua família ou cumprir o seu destino de dominar a Terra. Para fugir deste dilema conta com a ajuda de Pete! Como advertiu seu pai biológico, caso ele não cumprisse seu destino, as pessoas que amava sofreriam com isso!! E os fatos dirão por si!! Enquanto isso, Lex e Helen planejam o seu casamento, mas alguns acontecimentos fazem com que eles se separem. E Chloe, magoada, considera a oferta de Lionel para investigar Clark. Os fatos que sucederam sua decisão o fizeram partir de à Pequenópolis!!

Smallville (Kansas), em Outubro de 1989, é surpreendida por uma forte chuva de meteoros, o que causa destruição e mortes. Durante a tempestade, a pequena Lana, de 3 anos, assistiu à trágica morte de seus pais no colo da tia Nel; durante a mesma chuva, mas num milharal fora da cidade, está perdido o garoto Lex Luthor (filho do Milionário Sr. Luthor) que pela radiação fica careca. Jonathan e Martha Kent, um belo casal sem filhos, tem o carro atingido pelos meteoros e, ao retomarem a consciência, veem um pequeno garoto observando-os. O casal percebe que a espaçonave do garoto caiu junto com os meteoros sem ser detectada e, como ele veio ao encontro do casal, decidem adotá-lo, mantendo em segredo sua origem e chamando-o de Clark.

Greg, um nerd colecionador de insetos, também apaixonado por Lana, é atacado por insetos (que também foram atingidos pela radiação da chuva de meteoros). Desde então, passa a ter “características” (até físicas) de alguns insetos, a ponto de matar a própria mãe. Para "viabilizar" sua paixão , Greg provoca um acidente com o carro de Whitney , tenta matar Clark e faz de Lana sua prisioneira numa fábrica abandonada. Na luta com Greg, Clark percebe que os resíduos de criptonita (provenientes da chuva de meteoros) o enfraquecem, dá as dicas para Whitney salvar Lana... e ainda fica com os "créditos"!

Dan Lauria, o obcecado e temperamental treinador de futebol americano da escola de Clark, o convida para entrar no time. O pai de Clark não o autoriza, pois tem medo que sua força possa machucar alguém, mas mesmo assim o garoto entra em campo! Dan Lauria descobre que tem poder de provocar fogo por causa das pedras de criptonita que tem em sua sauna e por isso usa esse "dom" para eliminar todas as pessoas que possam interferir em seus planos, inclusive Clark! Lex, sob pressão, vai para Smallville para recuperar uma das fábricas de Luthor e, por seus métodos de administração serem muito diferentes dos de seu pai, os dois entram em Choque! L    ana fica decepcionada ao testemunhar que alguns jogadores colaram com o aval do técnico e deixa de ser animadora de torcida e se torna garçonete!

Clark começa a ter problemas na vista, o que significa que ele está desenvolvendo sua visão de Raio-X. Ao mesmo tempo, uma série de crimes acontecem envolvendo pessoas conhecidas, como por exemplo, o milionárrio Lex Luthor assaltando a um banco. Na verdade a responsável pelos crimes era Tina, garota que havia sido curada de problemas ósseos pela radiação da criptonita, e agora tem o poder de alterar-se fisicamente assumindo a forma física de outras    pessoas. Graças a sua visão de Raio-X, Clark será o único capaz de identificar e deter Tina!

O conquistador Sean, durante uma festa do colégio, numa noite fria, à beira de um lago congelado, se aproxima de Chloe, a grande amiga de Clark. Mesmo ao vê-la empolgada com a paquera, Clark avisa que não gosta dele! Minutos depois, sem que ninguém visse, Sean cai no lago congelado de onde, com muita luta, consegue sair. De lá ele traz também um estranho poder: absorver o calor de outras pessoas. Assim, Sean sai à procura de suas ex-paqueras para "descongelar-se" e Chloe está em sua lista. Ao descobrir o que acontecia, Clark deixa Lana sozinha em meio a um tão desejado encontro a sós, num concerto, para salvar a grande amiga das garras do homem-gelo!

Clark e Lana estão trabalhando como voluntários em uma casa de repouso para idosos. Ele se dedica principalmente a Sra. Cassandra, uma simpática velhinha cega que tem fama de prever o futuro (e realmente o faz, impressionando e preocupando Clark e depois o incrédulo Lex Luthor). Lana se ausenta por um minuto enquanto acompanhava o Sr. Harry num passeio de cadeira de rodas. Ele cai num pequeno lago com pedras de criptonita de onde, sem que ninguém visse, sai jovem. Seria a segunda chance pra Harry, um ex-criminoso, se vingar de todos as pessoas que o mandaram para a prisão anos atrás?

Uma garota gordinha se sente insatisfeita com seu corpo e resolve parar de comer e só ingerir uma "vitamina" com legumes cultivados em Smallville. Seu objetivo era estar bem para a festa do aniversário de Lana. Curiosamente ela começa a emagrecer e ao mesmo tempo fica perigosamente faminta! Clark se anima com a chance que teria de estar com Lana na festa, pois Whitney estaria fora.

Clark pela primeira vez vai ficar em casa por duas noites sem os pais, que estão viajando para Metrópolis. Então decide convidar alguns poucos amigos para uma reunião em casa... Mas aparecem muitos e fazem aquela bagunça! Enquanto rola a festa, Earl, um negro ex-funcionário de uma fábrica do poderoso Luthor, chega a casa para pedir ajuda ao Sr. Kent... Ele está quase morrendo com fortes tremedeiras e atribui sua doença a um suposto “Nível 3" (um laboratório secreto com pesquisas onde estaria fora de controle o uso do urânio). No dia seguinte, a turma da escola de Clark vai em excursão à tal fábrica a que Earl se referia . Para tentar se salvar, em desespero total, Earl faz o grupo refém para obrigar os Luthor a ajudá-lo!

Clark consegue parar com sua força um ônibus descontrolado e impedir a morte de um sem-teto. O caso foi encerrado pela polícia, mas um detetive corrupto descobre a força de Clark e começa a usar de chantagens contra ele e sua família querendo em troca que o rapaz faça roubos para favorecê-lo! Lex também já havia sido vítima desse mesmo detetive corrupto e tenta ajudar Clark (mas no fundo quer saber qual era o seu segredo). Ao mesmo tempo, Lana assume o jornal da escola depois de um desentendimento entre o diretor e Chloe, a grande amiga de Clark!

Amy, a filha de um dos casais empregados da mansão de Lex, é apaixonada por ele, mas está sofrendo com o namoro do rapaz com a bela Vitória!  Enquanto isso, Lana se desentende com Whitney e coordena a campanha de doação de sangue em Smallville. Fatos misteriosos começam a acontecer: objetos se movimentam, Lex é espancado... Com todos esses mistérios pra solucionar, Clark quase se declara para Lana!

Enquanto Chloe, Clark e Lana passeiam por uma floresta descobrem que um estranho homem, conhecido como eremita, estava por ali. O nome dele era Caio e desde então passa a ser um obstáculo para as ambições de Bob Rickman, dono de uma indústria de inseticidas que pretendia mudar seus negócios para Smallville! Bob tinha a fama de ser muito convincente a ponto de jamais perder um negócio. Ele tinha um estranho poder nas mãos que, ao cumprimentar alguém, a pessoa perdia os sentidos da razão e seguia suas instruções. E foi assim que fez o Sr. Kent vender seu rancho. Clark vai ter muito trabalho para derrotá-lo.

Enquanto Clark tenta salvar Eric, um garoto que ia se atirar num precipício, um raio os atinge e os poderes do Superboy são transferido para Eric. Assim, Clark se sente cansado, fraco, indisposto e lento. Diante disso, Eric começa a usar seus super poderes para causas menos nobres do que as de Clark.

Smallville vive uma onda de assaltos praticados por um bando de mascarados. Inclusive a mansão de Lex é invadida pelo bando que violentamente atinge Cloe. Enquanto Cloe se recupera no hospital, Clark se sente culpado por não a ter protegido dos fortões tatuados e que, misteriosamente, emitiam irradiações de uranio, o que fragilizou Clark. Muito triste pela amiga e intrigado, Clark resolve investigar os crimes sozinho. E ainda se surpreende quando Whitney é atraído pelo bando de criminosos.

Enquanto Lana prepara o velho cinema para ser reinaugurado, graças ao financiamento de Lex Luthor, recebe a visita de um estranho que se apresenta como Judy. Este homem também a assusta dizendo que tomasse cuidado com Lex, pois por onde ele está há sempre muita confusão. Para desespero de Lex , Judy não poderia estar vivo pois há três meses havia sido morto por um de seus seguranças numa boate, longe de Smallville. Judy faz da vida de Lex , e de todos que o rodeiam, um verdadeiro inferno.

Pai de Clark socorre um homem que estava dirigindo perigosamente e por isso jogou o carro pra fora da pista. Ao salvá-lo, Sr. Kent inspira um gás exalado por uma flor (a mesma que tinha provocado o acidente). Daí então ele se torna outro homem: violento, agressivo e com comportamentos anormais para sua personalidade. De repente cai e entra em coma, como o homem que ele socorreu. Lana e Petter também se tornam vítima dessa flor misteriosa. Desesperado ao ver o pai perto da morte, Clark e Cloe começam a investigar e descobrem que Lex havia contratado um professor pra pesquisar os efeitos da radiação nos seres humanos, mas , por gostar muito de botânica, direciona suas pesquisas pra uma tal flor de Nicodemus.

Ryan, um garoto usado por um casal para assaltar, foge da dupla e acaba atropelado por Marta. Após levá-lo ao pronto socorro, onde Ryan diz estar com amnésia, é acolhido pela família de Clark por uns dias. Ryan e Clark se dão super bem...principalmente porque Ryan também tem um super poder (lia os pensamentos das pessoas e descobre o segredo de clarck). Enquanto o garoto curtia sua nova família, a dupla de bandidos o perseguia pois sem ele os crimes não seriam tão fáceis.

O jovem Tyler atende ao pedido da mãe doente para ajudá-la a acabar com seu sofrimento. Os enfermeiros o flagram "sufocando" a própria mãe e, ao enfrentá-lo, é atirado do sexto andar. No necrotério, misteriosamente, Tyler renasce e ao tocar as pessoas as transforma em cinzas. Como sua mãe seria enterrada em Pequenópolis, Tyler segue pra lá e se torna uma ameaça para os poderes de Clark.

É tempo de eleição no colégio de Smallville. Os candidatos são: o oriental e tímido Paul Chang, a patricinha Felice, uma estranha garota chamada Sasha e, por vontade de Petter, Clark também se candidata. Chloe não concorda com a candidatura de Clark e por isso apóia Chang no jornal. Enquanto a campanha acontece, um enxame de abelhas ataca violentamente os dois primeiros candidatos sob o comando de Sasha...o próximo seria Clark. Ao mesmo tempo o café Tailon, administrado por Lana, passa por uma forte crise e Lex não quer ajudá-la.

O jovem cartunista Justin foi atropelado e acusa um médico de negligência. Petter mostra pra Clark que Cloe é apaixonada por ele e por isso Clark resolve tentar se aproximar dela e revela sua tática pra Lana. Enquanto isso, Justin, o cartunista que havia perdido parte dos movimentos das mãos no acidente, volta pra Smallville e se reaproxima de Chloe, inclusive afetivamente. Isso provoca ciúmes em Clark. A curiosidade em Justin está no fato de ter desenvolvido uma capacidade de fazer os objetos se moverem pelo poder da sua mente (telecinesia) e ele pretende usar seu novo poder para se vingar do motorista que o atropelou. Lana se vê quase pronta para acabar sua relação com Whitney quando o pai dele morre.

Lana é atingida por uma explosão e daí então começa a ter visões. É ela quem ajuda Clark a encontrar Cloe, que enquanto tentava se dirigir para um grande jornal onde tentava uma vaga como estagiária, acaba sequestrada. Enquanto isso, a família de Lex contrata uma equipe para analisar o terreno onde teria caído a nave.

Pai de Lex o surpreende fechando a fábrica de Smallville, mas Lex o desafia. Whitney, em meio a passeio romântico, avisa a Lana que irá pra marinha em poucos dias e pede para que ela o espere. Lana se limita ao silêncio. Ao mesmo tempo a família de Cloe se prepara para mudar. Enquanto Lana leva Whitney para rodoviária, Clark está com Cloe no tão badalado baile da primavera. Para desespero dos Kent um jornalista prepara armadilhas para Clark, chegando inclusive a descobrir a tal nave. Na volta da rodoviária Lana enfrenta um tornado e Clark tenta salvá-la.