Como o primeiro encontro entre Penny e Stuart não foi como sonharam, ambos pedem conselhos ao amigo Leonard. Não controlando seu ciúme, Leonard dá conselhos errados a Stuart e fica morrendo de curiosidade para saber como foi o encontro do casal. Enquanto isso, a invenção de Howard, um banheiro espacial, pode deixar a NASA em apuros a qualquer momento.

Leslie acaba o romance com Howard. Para tentar animá-lo, Raj e Leonard o acompanham numa hilária aventura em Las vegas. Enquanto isso, Sheldon, que se recusou a acompanhá-los, se vê preso do lado de fora da casa e sobra pra Penny aguentá-lo como hóspede.

Mais uma quinta-feira à noite e os rapazes decidem sair da rotina e vão à loja de quadrinhos, mas, desta vez, acompanhados por Penny. Naquele ambiente nerd, Penny procura por quadrinhos para o sobrinho, enquanto o dono da loja, Stuart, a paquera. Ao saber do encontro de Penny e Stuart no dia seguinte, Leonard, enciumado, sai pra beber com os amigos.

Os vizinhos do andar superior estão de mudança e Sheldon já se desespera temendo dias de barulho. Para a surpresa de todos, a nova inquilina é a bela e jovem Alicia, também atriz ,mas já com um curriculum mais "rico" do que Penny: ela acabou de conseguir um papel como prostituta num seriado. Penny e Alicia não se dão nada bem e a temperatura do ambiente sempre sobre quando se cruzam.

Penny se revela uma talentosa artesã confeccionando flores para cabelo. Ao perceber que o seu trabalho poderia ser mais valorizado, pede a Sheldon que a ajude na divulgação do produto. Assim, dia a dia aumentam as encomendas e, mesmo todos a ajudando dia e noite, não estão conseguindo cumprir os prazos.

Durante uma viagem de trem para um simpósio em São Francisco, Raj, Leonard, Howard e Sheldon descobrem que a bordo está também uma bela atriz do seriado "Terminator" e não se controlam: partem para a tietagem! Ainda no caminho, Sheldon percebe que esqueceu o pen drive que usaria na palestra e recorre a Penny!

Leslie se revela uma controladora em sua relação com Howard. Penny, numa brincadeira de paintball, acerta justamente a almofada que Sheldon utiliza para se sentar no sofá. Agora, desesperada, conta só com a ajuda de Leonard, para evitar que o neurótico Sheldon descubra a mancha.

Penny, em apuros financeiros, desabafa com Sheldon que, num rompante de solidariedade, lhe empresta dinheiro. Mal sabia ela quanta dor de cabeça esse empréstimo iria lhe render. Mesmo sabendo que a origem dos problemas de Penny era seu ex-namorado, Leonard se oferece para ajudá-la.

Os rapazes desenvolveram um robô que anda meio descontrolado, mas mesmo assim participam de um campeonato de robôs no sul da Califórnia. Num momento de desabafo Penny diz algumas verdades para Howard que fica tão deprimido que pode por a perder o trabalho do robô. Os rapazes pressionam Penny a pedir desculpas pelo o que disse a Howard.

Leonard passa de "inimigo" a companhia inseparável de David, um renomado cientista, e acaba deixando seus amigos de lado. Em clima de natal, Penny presenteia Sheldon e ele, pra variar, como não domina as regras básicas de convivência social, sofre procurando um presente pra ela. Ao saber que Penny está saindo com David, Leonard começa a sentir ciúmes.

Sheldon está impressionado com uma dor de ouvido, já até acredita que tem um tumor. Stephanie enfim conhece Penny e fica muito incomodada com a jovem vizinha. Leonard não sabe como dizer pra namorada se mudar, pedindo conselho para Penny, mas lhe falta coragem para encarar Steph.

Sheldon sabe que os relacionamentos de Leonard duram muito pouco. Por isso, ele se mantém sempre muito perto do amigo e da Dra. Seth, para garantir que não comenta os erros do passado! Entre gírias que não domina, Sheldon chega a pedir até a ajuda de Penny para que Leonard não perca a Dra. Steph.

A nova tática de Howard para atrair as mulheres é ser chamativo. Por isso ele aparece coberto de brilho e usando um tapa-olho! O plano parece funcionar, pois consegue atrair a Dra. Seth para uma área restrita do governo onde ele teria atolado uma sonda em Marte! Ao pedir socorro para os amigos, Seth conhece Leonard, por quem se declara apaixonada!

Penny está sem TV em casa e pede para assistir "American Next Top Model" na casa dos garotos! Todos pareciam curtir o programa até que Penny e Sheldon se estranham e ela acaba expulsa de lá. Para completar a confusão Raj e Howard aventuram-se procurando o endereço das garotas do reality show.

Dr. Sheldon com toda sua arrogância, dá uma palestra que humilha os presentes. Por mais incrível que possa parecer, dentre eles está uma aluna, Ramona, que se apresenta como fã do nerd. Mais surpresos ainda ficarão seus amigos quando ele chegar com Ramona em casa!

Sheldon procura alguém que lhe dê carona até o trabalho e Penny foi a escolhida! Para desespero do nerd, ela faz um caminho diferente do que Leonard costuma fazer e, por isso, passam pela Av. Euclides com todos os seus "quebra-molas". Irritada com tanta reclamação, Penny o faz descer do carro. Cansados da chatice do caronista, os amigos criam um simulador de direção para obrigá-lo a aprender a dirigir.

Raj está se sentindo "o cara", pois será entrevistado por uma famosa revista por constar na lista dos 30 mais notáveis com menos de 30 anos! O sucesso e o ego de Raj começa a incomodar os amigos. Zombado por todos, Raj convida Penny para acompanhá-lo no jantar da revista. Mas quando tem uma mulher ao seu lado, Raj também precisa de álcool.

Penny parece viver um inferno astral: enfrenta mais uma reprovação como atriz, está irritada por não fazer sexo há seis meses e. ao chegar em casa, a porta do apartamento não abre. Enquanto espera o chaveiro, Sheldon a convida para um "joguinho" no computador. Começa assim, para desespero de Sheldon e Leonard, sua nova fuga: games no computador!!

Com o fim do relacionamento, Penny tenta retomar sua vida. Acompanhada de um belo "amigo", ela cruza com os  rapazes no prédio! Incomodado com o que viu, Leonard aceita se reaproximar de Leslie Wincle, pessoa totalmente antipática a Sheldon!

Leonard e Penny percebem que o relacionamento não está fluindo como gostariam mas não tocam no assunto entre eles. Num momento de fragilidade, Penny confia em Sheldon e lhe conta seus problemas do relacionamento. Até quando Sheldon conseguirá manter o segredo de Penny?

Ao ver Penny chateada porque terminou o namoro, Leonard encontra uma chance para chamá-la para sair, e ela aceita. Mas os dois ficam em dúvida sobre esse encontro e perguntam a opinião de Sheldon.

Leonard conta que nunca teve uma festa de aniversário então Penny decide fazer uma surpresa para ele. Ela leva Sheldon para comprar um presente para o amigo em uma loja de eletrônicos, onde ele se diverte ajudando outros clientes. Enquanto isso, Howard é encarregado de enrolar Leonard e até come amendoim, mesmo sendo alérgico, só para ganhar tempo.

Leonard, Rajesh e Howard conhecem a irmã gêmea de Sheldon e se encantam por ela. Logo começa uma disputa entre eles para ver quem ganharia a garota, mas Sheldon tem outros planos para sua irmã.

Leonard compra a máquina do tempo de um filme em um leilão pela internet e seus amigos adoram! Mas Penny os chama de patéticos por gostarem desse tipo de brinquedo, chateando Leonard, que decide mudar.

Os garotos decidem participar de um torneio de física, mas tiram Sheldon da equipe porque ele não sabe competir, no lugar dele chamam Leslie, uma amiga cientista. Sheldon monta outro time para concorrer com eles.

Sheldon e Leonard são apresentados a Denis, um garoto de 15 anos que é físico. Sheldon fica com ciúme ao descobrir que além de mais novo, o menino é mais inteligente que ele. Os garotos ainda estranham ao ver que Denis não é "nerd" como eles, ele até namora.

Penny foi visitar sua família e diz que eles estavam com gripe, Sheldon, o mais preocupado com vírus, pega a doença. Leonard, Howard e Rajesh sabem o quanto insuportável Sheldon fica quando está doente. Então, sobra para Penny cuidar dele.

Penny vai substituir uma cantora em um musical e convida Leonard e Sheldon para assisti-la, mas como eles sabem que ela não canta bem, decidem dar desculpas para não terem que ir. Sheldon elabora uma desculpa e até contrata um ator para torná-la mais real.

Leonard e Sheldon recebem um convite para fazer uma palestra sobre um experimento deles em uma conferência de física, mas como Sheldon não quer ir, Leonard decide ir sozinho, o que resulta em briga entre os dois.

Os pais de Rajesh dão o telefone dele para uma amiga indiana que está nos Estados Unidos, para que eles se encontrem e marquem o casamento. Ele descobre que se beber consegue falar com mulheres e vai ao encontro, mas é Sheldon que acaba saindo com a garota.

Penny dorme na casa de Leonard e Sheldon porque uma amiga está em sua casa com Howard, o que muda toda a rotina dos garotos deixando Sheldon maluco, já que sua vida é baseada na matemática. Eles chegam até a convidar penny para jogar video game, pois tudo que fazem é em quatro pessoas.

Após a derrota em uma partida de paintball, os garotos são convidados para uma festa de Halloween na casa da Penny. Leonard acredita que é uma boa oportunidade para mostrar o que sente pela vizinha. Até o ex-namorado dela aparecer...

Sem conseguir conquistar Penny, Leonard começa a enxergar Leslie como um possível relacionamento. Mas como ele já havia levado um fora da cientista há tempos atras, não acredita muito que esse lance dê certo. Mas desta vez, Leslie parece mesmo estar afim.

Sheldom perde o emprego e aproveita para explorar a vida fora do mundo da física. Todos os dias ele tem uma obsessão nova. Mas o que fazer com tanto ócio e uma mente tão brilhante? Ele reluta em pedir seu emprego de volta, mas terá uma ajudinha....

Leonard se magoa ao ver Penny beijando outro homem e beija sua amiga cientista. Mas mesmo assim, acha que ainda tem chances e chama a vizinha para jantar.

Penny pede a Leonard e Sheldon que recebam seus novos móveis e levem para o apartamento dela, lá Sheldon, obcecado por limpeza e organização, não se conforma com a bagunça e volta à noite, enquanto Penny dorme, para arrumar a casa.

Leonard e Sheldon conhecem a nova vizinha, Penny, uma bela garçonete da fábrica de cheesecake. Leonard logo se apaixona por ela e faz tudo o que ela pede, incluindo ir na casa de seu ex-namorado para pegar sua televisão.